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Enregistrement W2120846931 · doi:10.1128/aem.68.8.3780-3789.2002

Identification, Characterization, and Regulation of a Cluster of Genes Involved in Carbapenem Biosynthesis in <i>Photorhabdus luminescens</i>

2002· article· en· W2120846931 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueApplied and Environmental Microbiology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueEntomopathogenic Microorganisms in Pest Control
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCentre National de la Recherche ScientifiqueInstitut national de la recherche scientifique
Mots-clésPhotorhabdus luminescensBiologyOperonPhotorhabdusGene clusterAutoinducerMicrobiologyQuorum sensingGeneGeneticsVirulenceEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The luminescent entomopathogenic bacterium Photorhabdus luminescens produces several yet-uncharacterized broad-spectrum antibiotics. We report the identification and characterization of a cluster of eight genes (named cpmA to cpmH) responsible for the production of a carbapenem-like antibiotic in strain TT01 of P. luminescens. The cpm cluster differs in several crucial aspects from other car operons. The level of cpm mRNA peaks during exponential phase and is regulated by a Rap/Hor homolog identified in the P. luminescens genome. Marker-exchange mutagenesis of this gene in the entomopathogen decreased antibiotic production. The luxS-like signaling mechanism of quorum sensing also plays a role in the regulation of the cpm operon. Indeed, luxS, which is involved in the production of a newly identified autoinducer, is responsible for repression of cpm gene expression at the end of the exponential growth phase. The importance of this carbapenem production in the ecology of P. luminescens is discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,390
Score d'incertitude au seuil0,208

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,143
Écart entre enseignants0,139 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle