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Enregistrement W2120920467 · doi:10.1042/bj20071460

A comprehensive model of purine uptake by the malaria parasite <i>Plasmodium falciparum</i>: identification of four purine transport activities in intraerythrocytic parasites

2008· article· en· W2120920467 sur OpenAlexaff
Neils B. Quashie, Dominique Dorin‐Semblat, Patrick G. Bray, Giancarlo A. Biagini, Christian Doerig, Lisa Ranford‐Cartwright, Harry P. de Koning

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePharmacological Effects and Toxicity Studies
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilMedical Research CouncilUniversity of GlasgowEuropean Commission
Mots-clésHypoxanthineNucleoside transporterPurineNucleosideTransporterBiochemistryAdenosinePlasmodium falciparumBiologyInosinePurine metabolismNucleotide salvageNucleotideGeneEnzymeMalariaImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plasmodium falciparum is incapable of de novo purine biosynthesis, and is absolutely dependent on transporters to salvage purines from the environment. Only one low-affinity adenosine transporter has been characterized to date. In the present study we report a comprehensive study of purine nucleobase and nucleoside transport by intraerythrocytic P. falciparum parasites. Isolated trophozoites expressed (i) a high-affinity hypoxanthine transporter with a secondary capacity for purine nucleosides, (ii) a separate high-affinity transporter for adenine, (iii) a low-affinity adenosine transporter, and (iv) a low-affinity/high-capacity adenine carrier. Hypoxanthine was taken up with 12-fold higher efficiency than adenosine. Using a parasite clone with a disrupted PfNT1 (P. falciparum nucleoside transporter 1) gene we found that the high-affinity hypoxanthine/nucleoside transport activity was completely abolished, whereas the low-affinity adenosine transport activity was unchanged. Adenine transport was increased, presumably to partly compensate for the loss of the high-affinity hypoxanthine transporter. We thus propose a model for purine salvage in P. falciparum, based on the highly efficient uptake of hypoxanthine by PfNT1 and a high capacity for purine nucleoside uptake by a lower affinity carrier.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,112
Score d'incertitude au seuil0,510

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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