Mutations induced by 2-amino-1-methyl-6-phenylimidazo [4,5-b]pyridine (PhIP) in cecum and proximal and distal colon of lacI transgenic rats
Notice bibliographique
Résumé
2-Amino-1-methyl-6-phenylimidazo[4,5-b]pyridine (PhIP) is a food-borne mutagen and carcinogen that induces tumors of the colon and the prostate gland in male rats and of the mammary gland in female rats. In this study we describe the frequency and specificity of PhIP-induced mutations in the cecum, proximal colon and distal colon of male and female lacI transgenic rats. This is the first report of mutational data from discrete regions of the colon. After 61 days of treatment with 200 p.p.m. PhIP mixed into the diet, PhIP-induced mutant frequencies were elevated 7-fold in the cecum and 14- to 21-fold in the colon of male and female rats compared with untreated controls. PhIP-induced mutant frequencies increased significantly (overall trend, P < 10(-4)) along the length of the colon of both males and females, with cecum < proximal colon < distal colon. A total of 754 PhIP mutants (363 male, 391 female) were sequenced to provide the mutational spectra for each of the three tissue sections from males and females. These mutational spectra consisted predominantly of G:C-->T:A and G:C-->C:G transversions and deletions of G:C base pairs. There were no significant differences between the mutational spectra with respect to sex or position in the colon. Therefore, we surmise that following induction of mutations by PhIP in male and female colons, non-mutagenic factors, possibly hormonal, preferentially influence the formation of tumors in the colon of male rats.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».