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Enregistrement W2120991684 · doi:10.1093/carcin/bgt184

miR-192, miR-194 and miR-215: a convergent microRNA network suppressing tumor progression in renal cell carcinoma

2013· article· en· W2120991684 sur OpenAlexafffund
Heba Khella, Marize Bakhet, Ghassan Allo, Michael A.S. Jewett, Andrew H. Girgis, Ashraf Latif, Hala Girgis, Ingo von Both, Georg A. Bjarnason, George M. Yousef

Notice bibliographique

RevueCarcinogenesis · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensSunnybrook Health Science CentreUniversity Health NetworkPrincess Margaret Cancer CentreSt. Michael's HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésmicroRNACancer researchGene knockdownBiologyMetastasisRenal cell carcinomaGene silencingTumor progressionClear cell renal cell carcinomaCancerCell growthCellCell culturePathologyMedicineGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MicroRNAs (miRNAs) play a crucial role in tumor progression and metastasis. We, and others, recently identified a number of miRNAs that are dysregulated in metastatic renal cell carcinoma compared with primary renal cell carcinoma. Here, we investigated three miRNAs that are significantly downregulated in metastatic tumors: miR-192, miR-194 and miR-215. Gain-of-function analyses showed that restoration of their expression decreases cell migration and invasion in renal cell carcinoma cell line models, whereas knockdown of these miRNAs resulted in enhancing cellular migration and invasion abilities. We identified three targets of these miRNAs with potential role in tumor aggressiveness: murine double minute 2, thymidylate synthase, and Smad Interacting protein 1/zinc finger E-box binding homeobox 2. We observed a convergent effect (the same molecule can be targeted by all three miRNAs) and a divergent effect (the same miRNA can control multiple targets) for these miRNAs. We experimentally validated these miRNA-target interactions using three independent approaches. First, we observed that miRNA overexpression significantly reduces the mRNA and protein levels of their targets. In the second, we observed significant reduction of the luciferase signal of a vector containing the 3'UTR of the target upon miRNA overexpression. Finally, we show the presence of inverse correlation between miRNA changes and the expression levels of their targets in patient specimens. We also examined the prognostic significance of miR-215 in renal cell carcinoma. Lower expression of miR-215 is associated with significantly reduced disease-free survival time. These findings were validated on an independent data set from The Cancer Genome Atlas. These results can pave the way to the clinical use of miRNAs as prognostic markers and therapeutic targets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations166
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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