Molecular Identification of Japanese Barberry (Berberis thunbergii) Cultivars Using Amplified Fragment Length Polymorphism
Notice bibliographique
Résumé
Plants of the genus Berberis have been forbidden entry in Canada because common barberry ( Berberis vulgaris ) is an alternate host for black stem rust of wheat. Japanese barberry ( Berberis thunbergii ), an ornamental shrub appreciated for its hardiness and attractiveness, is generally considered immune to rust. Therefore, the Canadian government has established a program allowing importation of 11 approved Japanese barberry cultivars. The success of the program relies on the proper identification of the approved varieties, which may not always be possible when the plant is dormant or missing some essential morphologic criteria. Therefore, a cultivar verification method has been established using the amplified fragment length polymorphism (AFLP) genotyping technique. The method was validated using DNA extracted from 41 plants sampled across the country and representing 23 Japanese barberry cultivars and representative of the 11 approved cultivars. The method successfully differentiated and confirmed the identity of all approved cultivars. Furthermore, the method was able to detect and identify two of six samples submitted for cultivar verification as mislabeled by the exporter because the AFLP patterns generated did not correspond to their reference cultivar patterns.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».