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Enregistrement W2121098529 · doi:10.1186/1742-4690-9-1

The role of G protein gene GNB3 C825TPolymorphism in HIV-1 acquisition, progression and immune activation

2012· article· en· W2121098529 sur OpenAlexafffund
Jennifer A. Juno, Jeffrey Tuff, Robert Y. Choi, Catherine M. Card, Joshua Kimani, Charles Wachihi, Sandra Koesters-Kiazyk, T. Blake Ball, Carey Farquhar, Francis A. Plummer, Grace John‐Stewart, Ma Luo, Keith R. Fowke

Notice bibliographique

RevueRetrovirology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesFogarty International CenterManitoba Health Research CouncilNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentUniversity of Manitoba
Mots-clésImmunologyImmune systemEx vivoCohortChemokineViral loadGenotypeCytokineCD38BiologyMedicineImmune dysregulationInternal medicineGeneticsHuman immunodeficiency virus (HIV)In vivoGeneStem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The GNB3 C825T polymorphism is associated with increased G protein-mediated signal transduction, SDF-1α-mediated lymphocyte chemotaxis, accelerated HIV-1 progression, and altered responses to antiretroviral therapy among Caucasian subjects. The GNB3 825T allele is highly prevalent in African populations, and as such any impact on HIV-1 acquisition or progression rates could have a dramatic impact. This study examines the association of the 825T polymorphism with HIV-1 acquisition, disease progression and immune activation in two African cohorts. GNB3 825 genotyping was performed for enrolees in both a commercial sex worker cohort and a perinatal HIV transmission (PHT) cohort in Nairobi, Kenya. Ex vivo immune activation was quantified by flow cytometry, and plasma chemokine levels were assessed by cytokine bead array. RESULTS: GNB3 genotype was not associated with sexual or vertical HIV-1 acquisition within these cohorts. Within the Pumwani cohort, GNB3 genotype did not affect HIV-1 disease progression among seroconverters or among HIV-1-positive individuals after adjustment for baseline CD4 count. Maternal CD4 decline and viral load increase in the PHT cohort did not differ between genotypes. Multi-parametric flow cytometry assessment of T cell activation (CD69, HLA-DR, CD38) and Treg frequency (CD25(+)FOXP3(+)) found no differences between genotype groups. Plasma SDF-1α, MIP-1β and TRAIL levels quantified by cytokine bead array were also similar between groups. CONCLUSIONS: In contrast to previous reports, we were unable to provide evidence to suggest that the GNB3 C825T polymorphism affects HIV-1 acquisition or disease progression within African populations. Ex vivo immune activation and plasma chemokine levels were similarly unaffected by GNB3 genotype in both HIV-1-negative and HIV-1-positive individuals. The paucity of studies investigating the impact of GNB3 polymorphism among African populations and the lack of mechanistic studies make it difficult to assess the true biological significance of this polymorphism in HIV-1 infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,258
Score d'incertitude au seuil0,259

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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