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Enregistrement W2121121404 · doi:10.1093/aob/mcm295

Pattern Selection in Plants: Coupling Chemical Dynamics to Surface Growth in Three Dimensions

2007· article· en· W2121121404 sur OpenAlexafffund
David M. Holloway, Lionel G. Harrison

Notice bibliographique

RevueAnnals of Botany · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of VictoriaBritish Columbia Institute of TechnologyUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaBritish Columbia Institute of TechnologyWestern Canada Research Grid
Mots-clésBrusselatorFlatteningBranching (polymer chemistry)BiologyGeometryBiological systemMechanicsPhysicsMaterials scienceMathematicsNonlinear system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND AIMS: A study is made by computation of the interplay between the pattern formation of growth catalysts on a plant surface and the expansion of the surface to generate organismal shape. Consideration is made of the localization of morphogenetically active regions, and the occurrence within them of symmetry-breaking processes such as branching from an initially dome-shaped tip or meristem. Representation of a changing and growing three-dimensional shape is necessary, as two-dimensional work cannot distinguish, for example, formation of an annulus from dichotomous branching. METHODS: For the formation of patterns of chemical concentrations, the Brusselator reaction-diffusion model is used, applied on a hemispherical shell and generating patterns that initiate as surface spherical harmonics. The initial shape is hemispherical, represented as a mesh of triangles. These are combined into finite elements, each made up of all the triangles surrounding each node. Chemical pattern is converted into shape change by moving nodes outwards according to the concentration of growth catalyst at each, to relieve misfits caused by area increase of the finite element. New triangles are added to restore the refinement of the mesh in rapidly growing regions. KEY RESULTS: The postulated mechanism successfully generates: tip growth (or stalk extension by an apical meristem) to ten times original hemisphere height; tip flattening and resumption of apical advance; and dichotomous branching and higher-order branching to make whorled structures. Control of the branching plane in successive dichotomous branchings is tackled with partial success and clarification of the issues. CONCLUSIONS: The representation of a growing plant surface in computations by an expanding mesh that has no artefacts constraining changes of shape and symmetry has been achieved. It is shown that one type of pattern-forming mechanism, Turing-type reaction-diffusion, acting within a surface to pattern a growth catalyst, can generate some of the most important types of morphogenesis in plant development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,527
Score d'incertitude au seuil0,993

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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