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Enregistrement W2121134690 · doi:10.1093/jnci/dju015

RE: Plasma Phospholipid Fatty Acids and Prostate Cancer Risk in the SELECT Trial

2014· letter· en· W2121134690 sur OpenAlexaff
J. Thomas Brenna, Graham C. Burdge, Michael A. Crawford, Paul Clayton, Stephen C. Cunnane, Rachel V. Gow, Joseph R. Hibbeln, Andrew J. Sinclair, John Stein, Peter Willatts

Notice bibliographique

RevueJNCI Journal of the National Cancer Institute · 2014
Typeletter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Lipids, and Metabolism
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProstate cancerPhospholipidProstateMedicineCancerChemistryInternal medicineOncologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We would like to take this opportunity to comment on the recent article by Brasky et al. ( 1 ). This study is a case–control study, measuring only associations rather than cause and effect, and it uses inappropriate measures of dietary exposure to omega-3 fatty acids, which show very low consumption levels overall. The abstract concludes by stating, “This study confirms previous reports of increased prostate cancer risk among men with high blood concentrations of LCω-3PUFA. The consistency of these findings suggests that these fatty acids are involved in prostate tumorigenesis. Recommendations to increase LCω-3PUFA intake should consider its potential risks” ( 1 ). We would like to draw your readers’ attention to the following matters of biological relevance in this study. First, the research used plasma phospholipid (PL) fatty acids as a measure of long-term intake of different fatty acids, but the literature regards plasma PL only as a measure of recent fat intakes ( 2 ). However, for the sake of our argument, let’s assume that plasma PL long-chain omega-3 fatty acids from blood taken some years ago can be used to grade risk of a disease many years later. The Brasky et al. study ( 1 ) reported levels of long-chain omega-3s that are in a very narrow range as follows: the no cancer group had mean levels of 4.48%, the low-grade cancer group had mean values of 4.66%, and the high-grade cancer group had levels of 4.71%. By way of comparison, vegetarians who consume no long-chain omega-3 have plasma PL long-chain omega-3 levels of 4.1% ( 3 ), and subjects fed a fish-rich diet for 2 weeks had plasma PL levels of 21.5% ( 4 ). Thus, the authors’ conclusion that a difference of 0.23% in omega-3 levels between the no cancer group and the high-grade cancer group is one that represents a biologically meaningful difference in long-chain omega-3 dietary intakes is fanciful. The statistics may give a P value implying significance, but the actual difference is so small as to be biologically irrelevant. The literature shows that this very narrow range of values is within the measurement error for these fatty acids. In fact, the authors suggest that all subjects had similar low dietary intakes. Thus, we believe the conclusions drawn substantially overstate the biological relevance of the research. The authors could have referred to a number of meta-analyses published recently, which have reported that intake of fish is associated with a reduction in deaths from prostate cancer, see for example, Szymanski et al. ( 5 ).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,030
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,048

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,030
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0230,021
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0140,014

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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