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Enregistrement W2121136440 · doi:10.1128/jvi.77.13.7281-7290.2003

High-Frequency Genetic Recombination and Reactivation of Orthopoxviruses from DNA Fragments Transfected into Leporipoxvirus-Infected Cells

2003· article· en· W2121136440 sur OpenAlexaff
Xiao-Dan Yao, David H. Evans

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePoxvirus research and outbreaks
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVacciniaBiologyVirologyVirusPoxviridaeOrthopoxvirusTransfectionFowlpox virusGeneGeneticsRecombinant DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Poxvirus DNA is not infectious because establishing an infection requires the activities of enzymes packaged in the virion. This barrier can be overcome by transfecting virus DNA into cells previously infected with another poxvirus, since the resident virus can provide the trans-acting systems needed to reactivate transfected DNA. In this study we show that cells infected with a leporipoxvirus, Shope fibroma virus (SFV), can reactivate vaccinia virus DNA. Similar heterologous packaging systems which used fowlpox-infected cells to reactivate vaccinia virus have been described, but SFV-infected cells promoted a far more efficient reaction that can produce virus titers exceeding 10(6) PFU/ micro g of transfected DNA. SFV-promoted reactions also exploit the hyperrecombinogenic systems previously characterized in SFV-infected cells, and these coupled recombination and reactivation reactions could be used to delete nonessential regions of the vaccinia virus genome and to reconstruct vaccinia virus from overlapping DNA fragments. SFV-catalyzed recombination reactions need only two 18- to 20-bp homologies to target PCR amplicons to restriction enzyme-cut vaccinia virus vectors, and this reaction feature was used to rapidly clone and express a gene encoding fluorescent green protein without the need for plaque purification or selectable markers. The ability of SFV-infected cells to reactivate fragments of vaccinia virus was ultimately limited by the number of recombinational exchanges required and one cannot reconstruct vaccinia virus from multiple PCR fragments spanning essential portions of the genome. These observations suggest that recombination is an integral part of poxvirus reactivation reactions and provide a useful new technique for altering the structure of poxvirus genomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,165
Score d'incertitude au seuil0,624

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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