MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2121214955 · doi:10.1373/clinchem.2012.184713

Reflections on the Founding of the International Cancer Genome Consortium

2012· article· en· W2121214955 sur OpenAlexafffundabout
Jennifer L. Jennings, Thomas J. Hudson

Notice bibliographique

RevueClinical Chemistry · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesOntario Institute for Cancer Research
Mots-clésGenomeCancerLibrary scienceComputational biologyMedicinePolitical scienceGerontologyBiologyGeneticsComputer scienceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Five years have passed since the strategy meeting that launched the International Cancer Genome Consortium (ICGC)4 in October 2007. The intervening 5 years have been a time of remarkable progress in cancer genome research, with great strides having been made toward understanding the mutational landscape of cancer and the early adoption of genome analyses in the clinical management of patients. Although progress in the field of cancer genomics has received wide coverage in the scientific literature and lay media, not much has been written about the events that led to the founding of the international consortium. Given our involvement in these events, we were asked to look back at the circumstances that attracted many of the world's leading cancer agencies, genome and cancer scientists, ethicists, computer scientists, and other experts to work together. The common purposes were to accelerate the discovery of many new cancer biomarkers and potential cancer targets and to spur the development of new clinical tests and therapeutic interventions that would benefit cancer patients worldwide. Fig. 1 is a slide from the opening talk at the International Cancer Genomics Strategy Meeting held in Toronto, Canada, on October 1 and 2, 2007. This meeting was convened by 6 organizations—the European Commission, Genome Canada, the National Cancer Institute, the National Human Genome Research Institute, the Ontario Institute for Cancer Research, and the Wellcome Trust. The meeting drew 122 participants from 22 countries, including world leaders in cancer genomics research, ethics, statistics, informatics, and pathology, as well as directors of funding agencies. International researchers and funding agencies used the forum to exchange knowledge and discuss the range of opportunities for a consortium initiative that would generate an atlas of genomic abnormalities in cancer. Fig. 1. Challenges and opportunities supporting the formation of the International Cancer Genome Consortium. TCGA, The Cancer Genome Atlas; WTSI CGP, Wellcome Trust Sanger Institute–Cancer Genome Project; TSP, Tumor Sequencing …

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,534
Score d'incertitude au seuil0,173

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,091
Tête enseignante GPT0,416
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2012
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueClinical ChemistryMême sujetCancer Genomics and DiagnosticsTravaux en français237 207