Mupirocin-Resistant, Methicillin-Resistant <i>Staphylococcus aureus</i> Strains in Canadian Hospitals
Notice bibliographique
Résumé
Mupirocin resistance in Staphylococcus aureus is increasingly being reported in many parts of the world. This study describes the epidemiology and laboratory characterization of mupirocin-resistant methicillin-resistant S. aureus (MRSA) strains in Canadian hospitals. Broth microdilution susceptibility testing of 4,980 MRSA isolates obtained between 1995 and 2004 from 32 Canadian hospitals was done in accordance with CLSI guidelines. The clinical and epidemiologic characteristics of strains with high-level mupirocin resistance (HLMup(r)) were compared with those of mupirocin-susceptible (Mup(s)) strains. MRSA strains were characterized by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) and typing of the staphylococcal chromosomal cassette mec. PCR was done to detect the presence of the mupA gene. For strains with mupA, plasmid DNA was extracted and subjected to Southern blot hybridization. A total of 198 (4.0%) HLMup(r) MRSA isolates were identified. The proportion of MRSA strains with HLMup(r) increased from 1.6% in the first 5 years of surveillance (1995 to 1999) to 7.0% from 2000 to 2004 (P < 0.001). Patients with HLMup(r) MRSA strains were more likely to have been aboriginal (odds ratio [OR], 3.7; 95% confidence interval [CI], 1.5 to 9.4; P = 0.006), to have had community-associated MRSA (OR, 2.2; 95% CI, 1.0 to 5.0; P = 0.05), and to have been colonized with MRSA (OR, 1.7; 95% CI, 1.0 to 3.0; P = 0.04). HLMup(r) MRSA strains were also more likely to be resistant to fusidic acid (21% versus 4% for mupirocin-susceptible strains; P < 0.001). All HLMup(r) MRSA strains had a plasmid-associated mupA gene, most often associated with a 9-kb HindIII fragment. PFGE typing and analysis of the plasmid profiles indicate that both plasmid transmission and the clonal spread of HLMup(r) MRSA have occurred in Canadian hospitals. These results indicate that the incidence of HLMup(r) is increasing among Canadian strains of MRSA and that HLMup(r) MRSA is recovered from patients with distinct clinical and epidemiologic characteristics compared to the characteristics of patents with Mup(s) MRSA strains.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».