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Enregistrement W2121266958 · doi:10.1655/herpetologica-d-14-00067

Molecular Phylogeny of the Lizard Clade Leiosaurae Endemic to Southern South America

2015· article· en· W2121266958 sur OpenAlexfundno aff
Mariana Morando, Melisa Olave, Luciano Javier Ávila, E. C. Stuart Baker, Jack W. Sites

Notice bibliographique

RevueHerpetologica · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueEvolution and Paleontology Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesOffice of International Science and EngineeringAgencia Nacional de Promoción Científica y TecnológicaConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y TécnicasFondo para la Investigación Científica y TecnológicaDalhousie UniversityBrigham Young UniversityUniversidad Austral de ChileNational Science Foundation
Mots-clésCladeLineage (genetic)MonophylyBiologyPhylogenetic treeGenusEvolutionary biologyZoologyPhylogeneticsEcologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The clade Leiosaurae currently includes 18 species in the genera Diplolaemus, Leiosaurus, and Pristidactylus. It is mainly distributed in Argentina from 30° latitude south in the northwestern region of the country, to 52° south in Patagonia, from 63° longitude in coastal areas to 73° along the Andean Cordillera, across multiple habitats and including a small area in Chile. Several morphological and molecular taxonomic studies on a subset of these species have been published, but no comprehensive phylogenetic hypothesis is available for the clade. The objective of this work is to present a molecular phylogenetic hypothesis for the majority of the described species in the clade. We sequenced two mitochondrial genes, five nuclear protein coding, and three anonymous nuclear loci, and implemented traditional concatenated analyses as well as a species-tree approach. All methods inferred very similar topologies. We found the genera Diplolaemus and Leiosaurus to be monophyletic, whereas P. torquatus was retrieved as a separate lineage from the other Pristidactylus species with strong statistical support. Within Diplolaemus, D. darwinii is a very distinct lineage with an estimated divergence time of ~14.74 million yr ago (mya). Based on an early Miocene Leiosaurae fossil mandible, we estimated the crown common ancestor of the genus Leiosaurus at ~9.24 mya, and L. bellii is the earliest divergent lineage within this genus. The Argentinean Pristidactylus species seem to have radiated relatively recently (4.02 mya). A combination of geological and climatic events during Middle and Late Miocene, and climatic changes associated with glaciations, most probably played a role in the divergence of the Leiosaurae clade. The diversification patterns of Diplolaemus and Leiosaurus seem to have followed a general south-to-north direction, while the Argentinean Pristidactylus may have diversified east-to-west and north-to-south. We suggest that morphological and thermo-physiological studies combined with palaeo-niche modeling analyses are needed to test these hypotheses and better understand the biogeographical history of this clade.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,047
Score d'incertitude au seuil0,844

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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