Allometric scaling in centrarchid fish: origins of intra- and inter-specific variation in oxidative and glycolytic enzyme levels in muscle
Notice bibliographique
Résumé
The influence of body size on metabolic rate, muscle enzyme activities and the underlying patterns of mRNA for these enzymes were explored in an effort to explain the genetic basis of allometric variation in metabolic enzymes. We studied two pairs of sister species of centrarchid fish: black bass (largemouth bass Micropterus salmoides and smallmouth bass Micropterus dolomieui) and sunfish (pumpkinseed Lepomis gibbosus and bluegill Lepomis macrochirus). Our goal was to assess the regulatory basis of both intraspecific and interspecific variation relative to body size, as well as to gain insights into the evolutionary constraints within lineages. Whole animal routine metabolic rate showed scaling coefficients not significantly different from 1, ranging from (+0.87 to +0.96). However, there were significant effects of body size on the specific activities of oxidative and glycolytic enzymes. Mass-specific activity of the oxidative enzyme citrate synthase (CS) scaled negatively with body size in each species, with scaling coefficients ranging from -0.15 to -0.19, whereas the glycolytic enzyme pyruvate kinase (PK) showed positive scaling, with scaling coefficients ranging from +0.08 to +0.23. The ratio of mass-specific enzyme activity in PK to CS increased with body size, whereas the ratio of mRNA transcripts of PK to CS was unaffected, suggesting the enzyme relationships were not due simply to transcriptional regulation of both genes. The mass-dependent differences in PK activities were best explained by transcriptional regulation of the muscle PK gene; PK mRNA was a good predictor of PK specific enzyme activity within species and between species. Conversely, CS mRNA did not correlate with CS specific enzyme activities, suggesting post-transcriptional mechanisms may explain the observed inter-specific and intraspecific differences in oxidative enzymes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».