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Enregistrement W2121275028 · doi:10.1242/jeb.003897

Allometric scaling in centrarchid fish: origins of intra- and inter-specific variation in oxidative and glycolytic enzyme levels in muscle

2007· article· en· W2121275028 sur OpenAlexaff
Rhiannon Davies, Christopher D. Moyes

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicropterusAllometryCitrate synthaseBiologyHexokinaseGlycolysisCentrarchidaeEnzyme assayBass (fish)Pyruvate kinaseEnzymeBiochemistryEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The influence of body size on metabolic rate, muscle enzyme activities and the underlying patterns of mRNA for these enzymes were explored in an effort to explain the genetic basis of allometric variation in metabolic enzymes. We studied two pairs of sister species of centrarchid fish: black bass (largemouth bass Micropterus salmoides and smallmouth bass Micropterus dolomieui) and sunfish (pumpkinseed Lepomis gibbosus and bluegill Lepomis macrochirus). Our goal was to assess the regulatory basis of both intraspecific and interspecific variation relative to body size, as well as to gain insights into the evolutionary constraints within lineages. Whole animal routine metabolic rate showed scaling coefficients not significantly different from 1, ranging from (+0.87 to +0.96). However, there were significant effects of body size on the specific activities of oxidative and glycolytic enzymes. Mass-specific activity of the oxidative enzyme citrate synthase (CS) scaled negatively with body size in each species, with scaling coefficients ranging from -0.15 to -0.19, whereas the glycolytic enzyme pyruvate kinase (PK) showed positive scaling, with scaling coefficients ranging from +0.08 to +0.23. The ratio of mass-specific enzyme activity in PK to CS increased with body size, whereas the ratio of mRNA transcripts of PK to CS was unaffected, suggesting the enzyme relationships were not due simply to transcriptional regulation of both genes. The mass-dependent differences in PK activities were best explained by transcriptional regulation of the muscle PK gene; PK mRNA was a good predictor of PK specific enzyme activity within species and between species. Conversely, CS mRNA did not correlate with CS specific enzyme activities, suggesting post-transcriptional mechanisms may explain the observed inter-specific and intraspecific differences in oxidative enzymes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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