MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2121296504 · doi:10.2337/diabetes.50.3.614

A Genome-Wide Scan for Abdominal Fat Assessed by Computed Tomography in the Quebec Family Study

2001· article· en· W2121296504 sur OpenAlexafffundabout
Louis Përusse, Treva Rice, Jean‐Pierre Després, Simone Lemieux, Sonia Roy, Michel Lacaille, My-Ann Ho-Kim, Michael A. Province, D. C. Rao, Claude Bouchard

Notice bibliographique

RevueDiabetes · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of General Medical SciencesMedical Research CouncilNational Institutes of HealthU.S. Public Health ServiceMedical Research Council Canada
Mots-clésGenome ScanGenetic linkageLinkage (software)MicrosatelliteChromosomeAbdomenQuantitative trait locusGeneticsBiologyMedicineAnatomyGeneAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To identify chromosomal regions harboring genes influencing the propensity to store fat in the abdominal area, a genome-wide scan for abdominal fat was performed in the Quebec Family Study. Cross-sectional areas of the amount of abdominal total fat (ATF) and abdominal visceral fat (AVF) were assessed from a computed tomography scan taken at L4-L5 in 521 adult subjects. Abdominal subcutaneous fat (ASF) was obtained by computing the difference between ATF and AVF. The abdominal fat phenotypes were adjusted for age and sex effects as well as for total amount of body fat (kilogram of fat mass) measured by underwater weighing, and the adjusted phenotypes were used in linkage analyses. A total of 293 microsatellite markers spanning the 22 autosomal chromosomes were typed. The average intermarker distance was 11.9 cM. A maximum of 271 sib-pairs were available for single-point (SIBPAL) and 156 families for multipoint variance components (SEGPATH) linkage analyses. The strongest evidence of linkage was found on chromosome 12q24.3 between marker D12S2078 and ASF (logarithm of odds [LOD] = 2.88). Another marker (D12S1045) located within 2 cM of D12S2078 also provided evidence of sib-pair linkage with ASF (P = 0.019), ATF (P = 0.015), and AVF (P = 0.0007). Other regions with highly suggestive evidence (P < 0.0023 or LOD > or =1.75) of multipoint linkage and evidence (P < 0.05) of single-point linkage, all for ASF, included chromosomes 1p11.2, 4q32.1, 9q22.1, 12q22-q23, and 17q21.1. Three of these loci (1p11.2, 9q22.1, and 17q21.1) are close to genes involved in the regulation of sex steroid levels, whereas two others (4q32.1 and 17q21.1) are in the proximity of genes involved in the regulation of food intake. This first genome-wide scan for abdominal fat assessed by computed tomography indicates that there may be several loci determining the propensity to store fat in the abdominal depot and that some of these loci may influence the development of diabetes in obese subjects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,078
Score d'incertitude au seuil0,433

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations152
Publié2001
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueDiabetesMême sujetGenetic Associations and EpidemiologyTravaux en français237 207