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Enregistrement W2121297175 · doi:10.2174/157340906778226409

An Introduction to Molecular Modeling of G-Protein Coupled Receptors

2006· article· en· W2121297175 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueCurrent Computer - Aided Drug Design · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésG protein-coupled receptorRhodopsinHomology modelingMetabotropic glutamate receptorRhodopsin-like receptorsComputational biologyClass C GPCRMetabotropic glutamate receptor 1BiologyChemistryMetabotropic receptorReceptorBiochemistryGlutamate receptorRetinal

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

G-protein coupled receptors (GPCRs) are the largest single family of signaling molecules in mammals and represent approximately 2-3% of all genes in the human genome. Estimates of the total number of GPCR genes in the human genome range from about 750 to 1000. GPCRs mediate signaling by a wide variety of ligands including amino acids, ions, biogenic amines, peptides, glycoproteins, light, pheromones, and odorants. There are presently only a handful of GPCRs whose structures have been elucidated. Of these, the mGluR1 subtype of metabotropic glutamate receptor (mGluR) and rhodopsin are the most widely used in modeling GPCRs. In the case of mGluR1, the three-dimensional structure of the extracellular ligand binding domain of the molecule has been solved, while the crystallographic data for rhodopsin encompasses the whole protein in the ground state with bound 11-cis-retinal. In this review, we discuss the use of homology modeling to investigate the structures and functions of GPCRs. We illustrate the use of homology modeling with a particular emphasis on ligand and drug binding sites in the Family C subfamily of GPCRs. Keywords: Homology modeling, ligand-receptor interaction, ligand docking, mGluR, Family C GPCRs, cysteine-rich domain, allosteric modulato

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,510
Score d'incertitude au seuil0,921

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle