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Enregistrement W2121318960 · doi:10.1111/j.1600-0722.2006.00318.x

Identification of secreted and membrane proteins in the rat incisor enamel organ using a signal‐trap screening approach

2006· article· en· W2121318960 sur OpenAlex
Pierre Moffatt, Charles E. Smith, Roy Sooknanan, René St‐Arnaud, Antonio Nanci

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal Of Oral Sciences · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone and Dental Protein Studies
Établissements canadiensAlethia Biotherapeutics (Canada)Université de MontréalShriners Hospitals for Children - Canada
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSignal peptideEndoplasmic reticulumSecretory proteinEnamel organBiologyComplementary DNACell biologyAmelogeninIntracellularMembrane proteinProtein subcellular localization predictionGeneMolecular biologyBiochemistryMembranePeptide sequenceEnamel paintAmeloblast

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The secretome represents the subset of proteins that are targeted by signal peptides to the endoplasmic reticulum. Among those, secreted proteins play a pivotal role because they regulate determinant cell activities such as differentiation and intercellular communication. In calcified tissues, they also represent key players in extracellular mineralization. This study was carried out to establish a secretome profile of rat enamel organ (EO) cells. A functional genomic technology, based on the signal trap methodology, was applied, starting with a library of 5'-enriched cDNA fragments prepared from rat incisor EOs. A total of 2,592 clones were analyzed by means of macroarray hybridizations and DNA sequencing. Ninety-four unique clones encoding a signal peptide were retrieved. Among those were 84 matched known genes, many not previously reported to be expressed by the EO. Most importantly, 10 clones were classified as being novel, with EO-009 identified as the rat homolog of human APin protein. These data indicate that many secreted and membrane-embedded EO proteins still remain to be identified, some of which may play crucial roles in regulating processes that create an optimal environment for the formation and organization of apatite crystals into a complex three-dimensional calcified matrix.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,725
Score d'incertitude au seuil0,168

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle