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Enregistrement W2121501171 · doi:10.1242/jeb.057000

jShaw1, a low-threshold, fast-activating Kv3 from the hydrozoan jellyfish<i>Polyorchis penicillatus</i>

2011· article· en· W2121501171 sur OpenAlexafffund
Rheanna M. Sand, Donna Atherton, Andrew N. Spencer, Warren J. Gallin

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensVancouver Island UniversityUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésXenopusJellyfishIon channelDepolarizationElectrophysiologyBiophysicsMembrane potentialPotassium channelVoltage-gated potassium channelVoltage clampBiologyChemistryAnatomyBiochemistryNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Voltage-gated potassium (K(v)) channels work in concert with other ion channels to determine the frequency and duration of action potentials in excitable cells. Little is known about K(v)3 channels from invertebrates, but those that have been characterized generally display slow kinetics. Here, we report the cloning and characterization of jShaw1, the first K(v)3 isolated from a cnidarian, the jellyfish Polyorchis penicillatus, in comparison with mouse K(v)3.1 and K(v)3.2. Using a two-electrode voltage clamp on Xenopus laevis oocytes expressing the channels, we compared steady-state and kinetic properties of macroscopic currents. jShaw1 is fast activating, and opens at potentials approximately 40 mV more hyperpolarized than the mouse K(v)3 channels. There is an inverse relationship between the number of positive charges on the voltage sensor and the half-activation voltage of the channel, contrary to what would be expected with the simplest model of voltage sensitivity. jShaw1 has kinetic characteristics that are substantially different from the mammalian K(v)3 channels, including a much lower sensitivity of early activation rates to incremental voltage changes, and a much faster voltage-dependent transition in the last stages of opening. jShaw1 opening kinetics were affected little by pre-depolarization voltage, in contrast to both mouse channels. Similar to the mouse channels, jShaw1 was half-blocked by 0.7 mmol l(-1) tetraethyl ammonium and 5 mmol l(-1) 4-aminopyridine. Comparison of sequence and functional properties of jShaw1 with the mouse and other reported K(v)3 channels helps to illuminate the general relationship between amino acid sequence and electrophysiological activity in this channel family.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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