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Enregistrement W2121512476 · doi:10.1080/0049825021000012637

Comparison of rat and human cytochrome P450 (CYP) sources of<i>N</i>-alkylprotoporphyrin IX. Formation after interaction with porphyrinogenic xenobiotics: studies with cDNA-expressed single CYP enzymes

2002· article· en· W2121512476 sur OpenAlexafffund
Jeremy T. Gamble, K. Nakatsu, Gerald S. Marks

Notice bibliographique

RevueXenobiotica · 2002
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésXenobioticCYP1A2Cytochrome P450EnzymeBiochemistryComplementary DNAMicrosomeChemistryCYP2B6CytochromeBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

1. The porphyrinogenicity of certain xenobiotics is due to mechanism-based inactivation of selected cytochrome P450 (CYP) enzymes, with concurrent formation of N-alkylprotoporphyrins (N-alkylPPs), which disrupt control of haem biosynthesis. An ambiguity arises when extrapolating results obtained with such porphyrinogenic xenobiotics in animals to humans owing to species' differences in CYP enzymes. The objective was to use cDNA-expressed individual rat CYP enzyme preparations in microsomes prepared from baculovirus-infected insect cells to determine which rat CYP enzymes were the source of N-alkylPPs after interaction with three porphyrinogenic xenobiotics and to compare the results with formation of N-alkylPPs in individual human CYP enzyme orthologues. 2. A sensitive fluorometric technique was employed to quantitate N-alkylPP formation after interaction of individual CYP enzymes with a porphyrinogenic xenobiotic. 3. N-alkylPP formation was found following the interaction of three porphyrinogenic xenobiotics with CYP1A2, 2B1, 2C6, 2C11 and 3A2, in amounts ranging from 0.45 to 0.07 nmol N-alkylPP nmol(-1) CYP. The results obtained with rat CYP1A2, 2C6, 2C11 and 3A2 were compared with those previously obtained with the human CYP orthologues 1A2, 2C9 and 3A4. 4. Some results corresponded while others did not, reinforcing a previous recommendation that when dealing with xenobiotics whose porphyrinogenicity depends upon interaction with CYP enzymes resulting in N-alkylPP formation, animal experiments should be augmented with studies using human CYP preparations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,147
Tête enseignante GPT0,418
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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