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Enregistrement W2121533469 · doi:10.1074/jbc.m009691200

Structure and Mechanism of Action of an Indolicidin Peptide Derivative with Improved Activity against Gram-positive Bacteria

2001· article· en· W2121533469 sur OpenAlexaff
Carol L. Friedrich, Annett Rozek, Aleksander Patrzykat, Robert E. W. Hancock

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPeptideBiochemistryChemistryAmino acidHistidinePeptide sequenceAlanineAromatic amino acidsStaphylococcus epidermidisBiologyStaphylococcus aureusBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Indolicidin, an antimicrobial peptide with a unique amino acid sequence (ILPWKWPWWPWRR-NH(2)) is found in bovine neutrophils. A derivative of indolicidin, CP10A, has alanine residues substituted for proline residues and has improved activity against Gram-positive organisms. Transmission electron microscopy of Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis treated with CP10A showed mesosome-like structures in the cytoplasm. The peptide at 2-fold the minimal inhibitory concentration did not show significant killing of S. aureus ISP67 (a histidine, uridine, and thymidine auxotroph) but did show an early effect on histidine and uridine incorporation and, later, an effect on thymidine incorporation. Upon interaction with liposomes, detergents, and lipoteichoic acid, CP10A was shown by circular dichroism spectroscopy to undergo a change in secondary structure. Fluorescence spectroscopy indicated that the tryptophan residues were located at the hydrophobic/hydrophilic interface of liposomes and detergent micelles and were inaccessible to the aqueous quencher KI. The three-dimensional structure of CP10A in the lipid mimetic dodecylphosphocholine was determined using two-dimensional NMR methods and was characterized as a short, amphipathic helical structure, whereas indolicidin was previously shown to have an extended structure. These studies have introduced a cationic peptide with a unique structure and an ability to interact with membranes and to affect intracellular synthesis of proteins, RNA, and DNA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations226
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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