MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2121599360 · doi:10.1128/iai.00674-07

Contribution of the<i>stg</i>Fimbrial Operon of<i>Salmonella enterica</i>Serovar Typhi during Interaction with Human Cells

2007· article· en· W2121599360 sur OpenAlexafffund
Chantal Forest, Sébastien P. Faucher, Katherine Poirier, Sébastien Houle, Charles M. Dozois, France Daigle

Notice bibliographique

RevueInfection and Immunity · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche ScientifiqueUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsPfizer
Mots-clésBiologyOperonMicrobiologySerotypeSalmonella typhiSalmonella entericaVirologyTyphoid feverSalmonellaGeneEscherichia coliGeneticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Salmonella serovars contain a wide variety of putative fimbrial systems that may contribute to colonization of specific niches. Salmonella enterica serovar Typhi is the etiologic agent of typhoid fever and is a pathogen specific to humans. In a previous study, we identified a gene, STY3920 (stgC), encoding the predicted usher of the stg fimbrial operon, that was expressed by serovar Typhi during infection of human macrophages. The stg genes are located in the glmS-pstS intergenic region in serovar Typhi and certain Escherichia coli strains, but they are absent in other S. enterica serovars. We cloned the stg fimbrial operon into a nonfimbriate E. coli K-12 strain and into S. enterica serovar Typhimurium. We demonstrated that the stg fimbrial operon contributed to increased adherence to human epithelial cells. Transcriptional fusion assays with serovar Typhi suggested that stg is preferentially expressed in minimal medium. Deletion of stg reduced adherence of serovar Typhi to epithelial cells. However, deletion of stg increased uptake of serovar Typhi by human macrophages, and overexpression of stg in serovar Typhi and serovar Typhimurium strains reduced phagocytosis by human macrophages. These strains survived inside macrophages as well as the wild-type parent. Although the stgC gene contains a premature stop codon that disrupts the expected open reading frame encoding the usher and is therefore considered a pseudogene, our results show that the stg operon may encode a functional fimbria. Thus, this serovar Typhi-specific fimbrial operon contributes to interactions with host cells, and further characterization is important for understanding the role of the stg fimbrial cluster in typhoid fever pathogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueInfection and ImmunityMême sujetSalmonella and Campylobacter epidemiologyTravaux en français237 207