A first‐generation microsatellite linkage map of the ruff
Notice bibliographique
Résumé
A linkage map of the ruff (Philomachus pugnax) genome was constructed based on segregation analysis of 58 microsatellite loci from 381 captive-bred individuals spanning fourteen breeding years and comprising 64 families. Twenty-eight of the markers were resolved into seven linkage groups and five single marker loci, homologous to known chicken (Gallus gallus) and zebra finch (Taeniopygia guttata) chromosomes. Linkage groups range from 10.1 to 488.7 cM in length and covered a total map distance of 641.6 cM, corresponding to an estimated 30-35% coverage of the ruff genome, with a mean spacing of 22.9 cM between loci. Through comparative mapping, we are able to assign linkage groups Ppu1, Ppu2, Ppu6, Ppu7, Ppu10, Ppu13, and PpuZ to chromosomes and identify several intrachromosomal rearrangements between the homologs of chicken, zebra finch, and ruff microsatellite loci. This is the first linkage map created in the ruff and is a major step toward providing genomic resources for this enigmatic species. It will provide an essential framework for mapping of phenotypically and behaviorally important loci in the ruff.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».