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Enregistrement W2121708521 · doi:10.1096/fj.10-178517

<i>In vivo</i> functional analysis and genetic modification of <i>in vitro</i> ‐derived mouse neutrophils

2011· article· en· W2121708521 sur OpenAlexaff
Jacqueline U. McDonald, Andrea Cortini, Marcela Rosas, Liliane Fossati‐Jimack, Guang Sheng Ling, Kimberley J. Lewis, Sharon Dewitt, Kate Liddiard, Gordon D. Brown, Simon A. Jones, Maurice B. Hallett, Marina Botto, Philip R. Taylor

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueNeutrophil, Myeloperoxidase and Oxidative Mechanisms
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesWellcome TrustWellcome
Mots-clésBiologyContext (archaeology)In vivoIn vitroCell biologyGeneFunction (biology)Immune systemTransduction (biophysics)Integrin alpha MComputational biologyImmunologyGeneticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mature neutrophils are notoriously short‐lived immune cells that cannot be genetically manipulated. Analysis of gene function therefore requires genetically modified animals, which is expensive, time‐consuming, and costly in animal life. Analysis of gene function in neutrophils in a physiologically relevant context thus represents a significant problem in the field. We sought to overcome this obstruction in the field by developing a strategy for the analysis of gene function in neutrophils in a physiologically relevant context. Here, we demonstrate the functional relevance of in vitro conditional‐Hoxb8 immortalized precursor‐derived neutrophils. In vitro ‐derived neutrophils functionally resembled primary neutrophils, but critically, neutrophils generated in this way can be adoptively transferred into live animals and tracked during inflammatory responses using single‐cell analysis to define functional attributes. We have validated this approach using CD11b‐deficient neutrophils and replicated the key findings observed in gene‐targeted animals and in naturally CD11b‐deficient humans. Furthermore, we show that by retroviral trans‐duction, one can generate stable alterations in the precursor cell lines and thus a continuous supply of functionally altered neutrophils. This novel technological advance offers for the first time the possibility of applying higher‐throughput genetic modification and in vivo functional analysis to the neutrophil‐lineage.—McDonald, J. U., Cortini, A, Rosas, M., Fossati‐Jimack, L., Ling, G. S., Lewis, K. J., Dewitt, S., Liddiard, K., Brown, G. D., Jones, S. A, Hallett, M. B., Botto, M., Taylor, P. R. In vivo functional analysis and genetic modification of in vitro ‐derived mouse neutrophils. FASEB J. 25, 1972‐1982 (2011). www.fasebj.org

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,600

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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