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Enregistrement W2121794037 · doi:10.1093/jxb/ern148

Adaptation of Arabidopsis to nitrogen limitation involves induction of anthocyanin synthesis which is controlled by the NLA gene

2008· article· en· W2121794037 sur OpenAlexafffund
Mingsheng Peng, Darryl Hudson, Andrew Craig Schofield, Rong Tsao, Ralph T. Yang, Honghui Gu, Yan Bi, Steven J. Rothstein

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Botany · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésArabidopsisMutantAnthocyaninBiologyArabidopsis thalianaMutagenesisBiochemistryCell biologyPhenylpropanoidLimitingGeneBotanyBiosynthesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plants can survive a limiting nitrogen (N) supply by developing a set of N limitation adaptive responses. However, the Arabidopsis nla (nitrogen limitation adaptation) mutant fails to produce such responses, and cannot adapt to N limitation. In this study, the nla mutant was utilized to understand further the effect of NLA on Arabidopsis adaptation to N limitation. Grown with limiting N, the nla mutant could not accumulate anthocyanins and instead produced an N limitation-induced early senescence phenotype. In contrast, when supplied with limiting N and limiting phosphorus (Pi), the nla mutants accumulated abundant anthocyanins and did not show the N limitation-induced early senescence phenotype. These results support the hypothesis that Arabidopsis has a specific pathway to control N limitation-induced anthocyanin synthesis, and the nla mutation disrupts this pathway. However, the nla mutation does not affect the Pi limitation-induced anthocyanin synthesis pathway. Therefore, Pi limitation induced the nla mutant to accumulate anthocyanins under N limitation and allowed this mutant to adapt to N limitation. Under N limitation, the nla mutant had a significantly down-regulated expression of many genes functioning in anthocyanin synthesis, and an enhanced expression of genes involved in lignin production. Correspondingly, the nla mutant grown with limiting N showed a significantly lower production of anthocyanins (particularly cyanidins) and an increase in lignin contents compared with wild-type plants. These data suggest that NLA controls Arabidopsis adaptability to N limitation by channelling the phenylpropanoid metabolic flux to the induced anthocyanin synthesis, which is important for Arabidopsis to adapt to N limitation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations270
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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