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Enregistrement W2121835129 · doi:10.1073/pnas.0502089102

Structures of microfilament destabilizing toxins bound to actin provide insight into toxin design and activity

2005· article· en· W2121835129 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueSynthetic Organic Chemistry Methods
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesArgonne National LaboratoryCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesU.S. Department of Energy
Mots-clésProtein filamentActinChemistryActin cytoskeletonCytoskeletonStereochemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Marine macrolides that disrupt the actin cytoskeleton are promising candidates for cancer treatment. Here, we present the actin-bound x-ray crystal structures of reidispongiolide A and C and sphinxolide B, three marine macrolides found among a recently discovered family of cytotoxic compounds. Their structures allow unequivocal assignment of the absolute configuration for each compound. A comparison of their actin-binding site to macrolides found in the trisoxazole family, as well as the divalent macrolide, swinholide A, reveals the existence of a common binding surface for a defined segment of their macrocyclic ring. This surface is located on a hydrophobic patch adjacent to the cleft separating domains 1 and 3 at the barbed-end of actin. The large area surrounding this surface accommodates a wide variety of conformations and designs observed in the macrocyclic component of barbed-end-targeting macrolides. Conversely, the binding pocket for the macrolide tail, located within the cleft itself, shows very limited variation. Functional characterization of these macrolides by using in vitro actin filament severing and polymerization assays demonstrate the necessity of the N-methyl-vinylformamide moiety at the terminus of the macrolide tail for toxin potency. These analyses also show the importance of stable interactions between the macrocyclic ring and the hydrophobic patch on actin for modifying filament structure and how this stability can be compromised by subtle changes in macrolactone ring composition. By identifying the essential components of these complex natural products that underlie their high actin affinity, we have established a framework for designing new therapeutic agents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,075
Score d'incertitude au seuil0,396

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle