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Enregistrement W2121857958 · doi:10.1128/jvi.01507-12

Selection and Characterization of Autographa californica Multiple Nucleopolyhedrovirus DNA Polymerase Mutations

2012· article· en· W2121857958 sur OpenAlexaff
Guozhong Feng, David Thumbi, Jondavid de Jong, Jeffrey J. Hodgson, Basil M. Arif, Daniel Doucet, Peter J. Krell

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueViral Infectious Diseases and Gene Expression in Insects
Établissements canadiensCanadian Forest ServiceUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyAphidicolinDNA polymerasePolymeraseVirologyDNA replicationAutographa californicaMolecular biologyViral replicationPoint mutationReverse transcriptaseAbacavirMutantVirusDNAGeneticsGenePolymerase chain reactionRecombinant DNAViral loadSpodoptera

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Autographa californica multiple nucleopolyhedrovirus (AcMNPV) DNA polymerase (DNApol) is essential for viral DNA replication. AcMNPV mutants resistant to aphidicolin, a selective inhibitor of viral DNA replication, and abacavir, an efficacious nucleoside analogue with inhibitory activity against reverse transcriptase, were selected by the serial passage of the parental AcMNPV in the presence of increasing concentrations of aphidicolin or abacavir. These drug-resistant mutants had either a single (C543R) (aphidicolin) or a double (C543R and S611T) (abacavir) point mutation within conserved regions II and III. To confirm the role of these point mutations in AcMNPV DNA polymerase, a dnapol knockout virus was first generated, and several repair viruses were constructed by transposing the dnapol wild-type gene or ones containing a single or double point mutation into the polyhedrin locus of the dnapol knockout bacmid. The single C543R or double C543R/S611T mutation showed increased resistance to both aphidicolin and abacavir and, even in the absence of drug, decreased levels of virus and viral DNA replication compared to the wild-type repair virus. Surprisingly, the dnapol mutant repair viruses led to the generation of occlusion-derived viruses with mostly single and only a few multiple nucleocapsids in the ring zone and within polyhedra. Thus, these point mutations in AcMNPV DNA polymerase increased drug resistance, slightly compromised virus and viral DNA replication, and influenced the viral morphogenesis of occlusion-derived virus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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