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Enregistrement W2121884008 · doi:10.1128/jb.182.2.348-356.2000

Early Cephamycin Biosynthetic Genes Are Expressed from a Polycistronic Transcript in <i>Streptomyces clavuligerus</i>

2000· article· en· W2121884008 sur OpenAlexafffund
Dylan C. Alexander, Michael J. Brumlik, Linda Lee, Susan E. Jensen

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMicrobial Natural Products and Biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaBD
Mots-clésBiologyStreptomyces clavuligerusStreptomycesGeneStreptomycetaceaeGeneticsActinomycetalesBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A polycistronic transcript that is initiated at the lat promoter has been implicated in the expression of the genes involved in early steps of cephamycin C biosynthesis in Streptomyces clavuligerus. pcbC is also expressed as a monocistronic transcript from its own promoter. However, an alternative interpretation involving expression via three separate yet interdependent transcripts has also been proposed. To distinguish between these possibilities, mutants lacking the lat promoter and containing a transcription terminator within the lat gene (Deltalat::tsr/term mutants) were created. This mutation eliminated the production of lysine-epsilon-aminotransferase (the lat gene product) but also affected the expression of downstream genes, indicating an operon arrangement. Production of delta-(L-alpha-aminoadipyl)-L-cysteinyl-D-valine synthetase (ACVS) (the pcbAB gene product) was eliminated in Deltalat::tsr/term mutants, while production of isopenicillin N synthase (IPNS) (the pcbC gene product) was greatly reduced. The provision of alpha-aminoadipate to the Deltalat::tsr/term mutants, either via exogenous feeding or via lat gene complementation, did not restore production of ACVS or IPNS. Analysis of RNA isolated from the Deltalat::tsr/term mutants confirmed that the polycistronic transcript was absent but also indicated that monocistronic pcbC transcript levels were greatly decreased. In contrast, Deltalat mutants created by in-frame internal deletion of lat maintained the polycistronic transcript and allowed production of wild-type levels of both ACVS and IPNS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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