Characterisation of Calmodulin Structural Transitions by Ion Mobility Mass Spectrometry
Notice bibliographique
Résumé
This study demonstrates the ability of travelling wave ion mobility-mass spectrometry to measure collision cross-sections of ions in the negative mode, using a calibration based approach. Here, negative mode ion mobility-mass spectrometry was utilised to understand structural transitions of calmodulin upon Ca2+ binding and complexation with model peptides melittin and the plasma membrane Ca2+ pump C20W peptide. Coexisting calmodulin conformers were distinguished on the basis of their mass and cross-section, and identified as relatively folded and unfolded populations, with good agreement in collision cross-section to known calmodulin geometries. Titration of calcium tartrate to physiologically relevant Ca2+ levels provided evidence for intermediately metalated species during the transition from apo- to holo-calmodulin, with collision cross-section measurements indicating that higher Ca2+ occupancy is correlated with more compact structures. The binding of two representative peptides which exemplify canonical compact (melittin) and extended (C20W) peptide-calmodulin binding models has also been interrogated by ion mobility mass spectrometry. Peptide binding to calmodulin involves intermediates with metalation states from 1–4 Ca2+, which demonstrate relatively collapsed structures, suggesting neither the existence of holo-calmodulin or a pre-folded calmodulin conformation is a prerequisite for binding target peptides or proteins. The biological importance of the different metal unsaturated calmodulin complexes, if any, is yet to be understood.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,010 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».