Structural analysis of lipopolysaccharide produced by Heddleston serovars 10, 11, 12 and 15 and the identification of a new Pasteurella multocida lipopolysaccharide outer core biosynthesis locus, L6
Notice bibliographique
Résumé
Pasteurella multocida is a Gram-negative bacterial pathogen classified into 16 serovars based on lipopolysaccharide (LPS) antigens. Previously, we have characterized the LPS outer core biosynthesis loci L1, L2, L3, L5 and L7, and have elucidated the full range of LPS structures associated with each. In this study, we have determined the LPS structures produced by the type strains representing the serovars 10, 11, 12 and 15 and characterized a new LPS outer core biosynthesis locus, L6, common to all. The L6 outer core biosynthesis locus shares significant synteny with the L3 locus but due to nucleotide divergence, gene duplication and gene redundancy, the L6 and L3 LPS outer cores are structurally distinct. Using LPS structural and genetic differences identified in each L6 strain, we have predicted a role for most of the L6 glycosyltransferases in LPS assembly. Importantly, we have identified two glycosyltransferases, GctD and GatB, that differ by one amino acid, A162T, but use different donor sugars [uridine diphosphate (UDP)-Glc and UDP-Gal, respectively]. The longest outer core oligosaccharide, produced by the serovar 12 type strain, contained a terminal region consisting of β-Gal-(1,4)-β-GlcNAc-(1,3)-β-Gal-(1,4)-β-Glc that was identical in structure to the vertebrate glycosphingolipid, paragloboside. Mimicry of host glycosphingolipids has been observed previously in P. multocida strains belonging to L3 LPS genotype, which produce LPS similar in structure to the globo-series of glycosphingolipids. The expression of a paragloboside-like oligosaccharide on the LPS produced by the serovar 12 type strain indicates that strains belonging to the L6 LPS genotype may also engage in molecular mimicry.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».