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Enregistrement W2121905340 · doi:10.1093/jnci/djp392

A New Generation of Studies of Human Papillomavirus DNA Testing in Cervical Cancer Screening

2009· letter· en· W2121905340 sur OpenAlexaff
Eduardo L. Franco

Notice bibliographique

RevueJNCI Journal of the National Cancer Institute · 2009
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPapanicolaou stainCervical cancerCervical intraepithelial neoplasiaMedicineContext (archaeology)Papanicolaou TestCancerGynecologyOncologyInternal medicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

“All zoogles are boogles. You saw a boogle. Is it a zoogle?” Question in an SAT examination (Nassim Nicholas Taleb in “The Black Swan”) “Not necessarily” is the resounding answer to this thought experiment, in analogy to the central argument in the debate on the clinical utility of human papillomavirus (HPV) testing in cervical cancer screening. Virtually all cervical cancers are caused by infections with oncogenic HPV types ( 1 ). However, does a positive HPV DNA test result indicate that cervical cancer or precancerous lesion is present or imminent for a woman attending routine screening? Although most cervical HPV infections, even those with oncogenic types, will be inconsequential, it is also true that a provider will be more likely to find cervical cancers or their precursors if screening is with HPV DNA testing rather than with Papanicolaou cytology ( 2 , 3 ). This extra sensitivity exacts a penalty on the specificity of HPV DNA testing, which (by design) detects the presence of viral DNA in cervical cells irrespective of whether or not the molecular changes are in the context of an infection that has already produced morphological abnormalities recognizable by cytology. In other words, HPV DNA testing brings the focus of screening “upstream” in the natural history of cervical neoplasia relative to the decades-old paradigm of Papanicolaou cytology. Returning to the above thought experiment, all cervical cancers arise from cervical intraepithelial neoplasia (CIN), whose grade correlates with the extent of Papanicolaou abnormality. Although it is easier to find a “zoogle” with the HPV DNA “boogle” identifier than with the Papanicolaou “boogle” identifier, the latter will have fewer false positives than the former.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,028
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,069
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,149

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0280,069
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0060,006
Études des sciences et des technologies0,0010,004
Communication savante0,0050,009
Science ouverte0,0020,004
Intégrité de la recherche0,0040,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0130,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,382
Tête enseignante GPT0,471
Écart entre enseignants0,089 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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