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Enregistrement W2121958456 · doi:10.1158/0008-5472.can-05-0308

Epidermal Growth Factor Receptor Signaling Is Up-regulated in Human Colonic Aberrant Crypt Foci

2006· article· en· W2121958456 sur OpenAlexaff
Greg Cohen, Reba Mustafi, Anusara Chumsangsri, Nathaniel Little, Jeff Nathanson, Sandra Cerda, Sujatha Jagadeeswaran, Urszula Dougherty, Loren Joseph, John Hart, Lisa Yerian, Maria Tretiakova, Weihua Yuan, Piotr Obara, Sharad Khare, Frank A. Sinicrope, Alessandro Fichera, Gerry R. Boss, Robert E. Carroll, Marc Bissonnette

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueColorectal Cancer Treatments and Studies
Établissements canadiensImmunovaccine (Canada)
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Cancer Institute
Mots-clésEpidermal growth factor receptorBiologyProliferating cell nuclear antigenPathologyEpidermal growth factorAberrant crypt fociCyclin D1KinaseGrowth factor receptorMolecular biologyCancer researchGrowth factorReceptorSignal transductionColorectal cancerImmunohistochemistryCancerMedicineCell cycleImmunologyCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aberrant crypt foci (ACF) are collections of abnormal colonic crypts with heterogeneous molecular and pathologic characteristics. Large and dysplastic ACF are putative precursors of colon cancer with neoplastic risk related to increased proliferation. In this study, we examined the role of epidermal growth factor receptor (EGFR) signaling in regulating ACF proliferation. Using magnification chromoendoscopy, we collected large ACF with endoscopic features of dysplasia and separately biopsied adjacent mucosa. Transcript levels were measured by real-time PCR, proteins were assessed by Western blotting, and levels were expressed as fold changes of adjacent mucosa. K-ras and B-Raf mutations were assessed by PCR and Ras activation by the ratio Ras-GTP / (Ras-GTP + Ras-GDP). At the RNA level, 38% of ACF were hyperproliferative, with proliferating cell nuclear antigen (PCNA) mRNA >/=2-fold of adjacent mucosa. Hyperproliferative ACF had significantly increased mRNA levels of EGFR (6.0 +/- 1.7-fold), transforming growth factor-alpha (14.4 +/- 5.0-fold), heparin-binding EGF-like growth factor (4.5 +/- 1.4-fold), cyclin D1 (4.6 +/- 0.7-fold), and cyclooxygenase-2 (COX-2; 9.3 +/- 4.2-fold; P < 0.05). At the protein level, 46% of ACF were hyperproliferative (PCNA, 3.2 +/- 1.2-fold). In hyperproliferative ACF, 44% possessed significant increases in four EGFR signaling components: EGFR (9.5 +/- 1.3-fold), phosphoactive ErbB2 (2.6 +/- 0.4-fold), phosphoactive extracellular signal-regulated kinase (3.7 +/- 1.1-fold), and cyclin D1 (3.4 +/- 0.8-fold; P < 0.05). Ras was activated in 46% of ACF (3.2 +/- 0.4-fold; P < 0.05), but K-ras mutations were present in only 7% of ACF. In contrast to COX-2 mRNA, the protein was not increased in hyperproliferative ACF. In summary, we have shown that ACF with up-regulated PCNA possess increased EGFR signaling components that likely contribute to the enhanced proliferative state of dysplastic-appearing ACF.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,293
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,091
Tête enseignante GPT0,410
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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