IL17A genetic variation is associated with altered susceptibility to Gram-positive infection and mortality of severe sepsis
Notice bibliographique
Résumé
INTRODUCTION: Interleukin 17A (IL17A) plays a key role in host defense against microbial infection including Gram-positive bacteria. Genetic factors contribute to the host defense, but the role of IL17A single nucleotide polymorphisms (SNPs) has not yet been investigated in severe sepsis. Therefore, we hypothesized that SNPs in the IL17A gene alter susceptibility to infection and clinical outcome of severe sepsis. METHODS: We tested for the association of IL17A SNPs with susceptibility to infection and clinical outcome of severe sepsis using two cohorts of European ancestry (derivation cohort, St Paul's Hospital (SPH), n = 679; validation cohort, Vasopressin and Septic Shock Trial (VASST), n = 517). The primary outcome variable was susceptibility to Gram-positive bacterial infection. The secondary outcome variable was 28-day mortality. RESULTS: Of four tested IL17A tag SNPs (rs4711998, rs8193036, rs2275913, rs1974226), rs1974226 SNP was associated with altered susceptibility to Gram-positive infection in the derivation SPH cohort (corrected P = 0.014). Patients having the rs1974226 GG genotype were more susceptible to Gram-positive infection, compared to AG/AA genotype in the two cohorts of severe sepsis (SPH, P = 0.0036, odds ratio (OR) 2.19, 95% confidence interval (CI) 1.28-3.72; VASST, P = 0.011, OR 1.95, 95%CI 1.16-3.27) and in the subgroup having lung infection (P = 0.017, OR 1.90, 95%CI 1.12-3.21). Furthermore, the IL17A rs1974226 G allele was associated with increased 28-day mortality in two cohorts (SPH, adjusted OR 1.44, 95%CI 1.04-2.02, P = 0.029; VASST, adjusted OR 1.67, 95%CI 1.17-2.40, P = 0.0052). CONCLUSIONS: IL17A genetic variation is associated with altered susceptibility to Gram-positive infection and 28-day mortality of severe sepsis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».