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Enregistrement W2121976840 · doi:10.1186/cc10515

IL17A genetic variation is associated with altered susceptibility to Gram-positive infection and mortality of severe sepsis

2011· article· en· W2121976840 sur OpenAlexafffund
Taka‐aki Nakada, James A. Russell, John H. Boyd, Keith R. Walley

Notice bibliographique

RevueCritical Care · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePsoriasis: Treatment and Pathogenesis
Établissements canadiensSt. Paul's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Sanitarium AssociationHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésSepsisMedicineSingle-nucleotide polymorphismOdds ratioCohortGenotypeSeptic shockInternal medicineSNPImmunologyBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Interleukin 17A (IL17A) plays a key role in host defense against microbial infection including Gram-positive bacteria. Genetic factors contribute to the host defense, but the role of IL17A single nucleotide polymorphisms (SNPs) has not yet been investigated in severe sepsis. Therefore, we hypothesized that SNPs in the IL17A gene alter susceptibility to infection and clinical outcome of severe sepsis. METHODS: We tested for the association of IL17A SNPs with susceptibility to infection and clinical outcome of severe sepsis using two cohorts of European ancestry (derivation cohort, St Paul's Hospital (SPH), n = 679; validation cohort, Vasopressin and Septic Shock Trial (VASST), n = 517). The primary outcome variable was susceptibility to Gram-positive bacterial infection. The secondary outcome variable was 28-day mortality. RESULTS: Of four tested IL17A tag SNPs (rs4711998, rs8193036, rs2275913, rs1974226), rs1974226 SNP was associated with altered susceptibility to Gram-positive infection in the derivation SPH cohort (corrected P = 0.014). Patients having the rs1974226 GG genotype were more susceptible to Gram-positive infection, compared to AG/AA genotype in the two cohorts of severe sepsis (SPH, P = 0.0036, odds ratio (OR) 2.19, 95% confidence interval (CI) 1.28-3.72; VASST, P = 0.011, OR 1.95, 95%CI 1.16-3.27) and in the subgroup having lung infection (P = 0.017, OR 1.90, 95%CI 1.12-3.21). Furthermore, the IL17A rs1974226 G allele was associated with increased 28-day mortality in two cohorts (SPH, adjusted OR 1.44, 95%CI 1.04-2.02, P = 0.029; VASST, adjusted OR 1.67, 95%CI 1.17-2.40, P = 0.0052). CONCLUSIONS: IL17A genetic variation is associated with altered susceptibility to Gram-positive infection and 28-day mortality of severe sepsis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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