Genetic consequences of interbreeding between farmed and wild Atlantic salmon: insights from the transcriptome
Notice bibliographique
Résumé
Large annual escapees of farmed Atlantic salmon enhance the risk of extinction of wild populations through genetic and ecological interactions. Recently, we documented evolutionary change in gene transcription between farmed and wild Atlantic salmon after only five generations of artificial selection. While differences for most quantitative traits are expected to gradually dilute through repeated backcrossing to wild populations, the genetic basis of gene transcription has been shown to be largely nonadditive and hybrid crosses may display unexpected inheritance patterns. This makes it difficult to predict to what extent interbreeding between farmed and wild individuals will change the genetic makeup of wild salmon populations. Here, we compare the genome-wide gene transcription profiles of Norwegian wild salmon to that of a second generation hybrid cross [backcross: (Farmed X Wild) X Wild]. Over 6% (298, q-value < 0.01) of the detected genes exhibited highly significantly different transcription levels, and the range and average magnitude of those differences was strikingly higher than previously described between pure farmed and wild strains. Most differences appear to result from nonadditive gene interactions. These results suggest that interbreeding of fugitive farmed salmon and wild individuals could substantially modify the genetic control of gene transcription in natural populations exposed to high migration from fish farms, resulting in potentially detrimental effects on the survival of these populations. This further supports the idea that measures to considerably reduce the number of escaped farmed salmon and their reproduction in the wild are urgently needed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».