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Enregistrement W2122188257 · doi:10.1074/jbc.m703834200

The Diaphanous Inhibitory Domain/Diaphanous Autoregulatory Domain Interaction Is Able to Mediate Heterodimerization between mDia1 and mDia2

2007· article· en· W2122188257 sur OpenAlexaff
Sarah J. Copeland, Brenda J. Green, Sarah Burchat, Giuseppe A. Papalia, David W. Banner, John W. Copeland

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésForminsCell biologyActinMDia1ChemistryHomology (biology)BiologyCytoskeletonActin cytoskeletonBiochemistryGeneCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Formins are multidomain proteins that regulate numerous cytoskeleton-dependent cellular processes. These effects are mediated by the presence of two regions of homology, formin homology 1 and FH2. The diaphanous-related formins (DRFs) are distinguished by the presence of interacting N- and C-terminal regulatory domains. The GTPase binding domain and diaphanous inhibitory domain (DID) are found in the N terminus and bind to the diaphanous autoregulatory domain (DAD) found in the C terminus. Adjacent to the DID is an N-terminal dimerization motif (DD) and coiled-coil region (CC). The N terminus of Dia1 is also proposed to contain a Rho-independent membrane-targeting motif. We undertook an extensive structure/function analysis of the mDia1 N terminus to further our understanding of its role in vivo. We show here that both DID and DD are required for efficient autoinhibition in the context of full-length mDia1 and that the DD of mDia1 and mDia2, like formin homology 2, mediates homo- but not heterodimerization with other DRF family members. In contrast, our results suggest that the DID/DAD interaction mediates heterodimerization of full-length mDia1 and mDia2 and that the auto-inhibited conformation of DRFs is oligomeric. In addition, we also show that the DD/CC region is required for the Rho-independent membrane targeting of the isolated N terminus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,107
Score d'incertitude au seuil0,520

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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