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Enregistrement W2122243839 · doi:10.1074/jbc.m303117200

Characterization of Opticin and Evidence of Stable Dimerization in Solution

2003· article· en· W2122243839 sur OpenAlexaff
Magali M. Le Goff, V. John Hindson, Thomas A. Jowitt, Paul G. Scott

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMolecular spectroscopy and chirality
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesWellcome Trust
Mots-clésCharacterization (materials science)ChemistryMaterials scienceNanotechnology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Opticin is a class III member of the extracellular matrix small leucine-rich repeat protein (SLRP) family that was initially identified in the eye in association with the collagen fibrils of the vitreous humor. Recombinant and tissue-extracted forms of bovine opticin were subjected to biochemical and biophysical characterization. Following SDS-PAGE the predominant component produced by both forms was a broad band between 45-52 kDa. There was evidence for two-stage processing and, additionally, a proteolytic cleavage product of approximately 25 kDa. Deconvolution of circular dichroism spectra revealed beta-sheet (41%), beta-turn (21%), and alpha-helix (10%), and thermal denaturation experiments showed a transition with a midpoint of 47 degrees C. Weight-averaged molecular mass measurements using both light scattering and analytical ultracentrifugation demonstrated that opticin exists in solution as a stable dimer of approximately 90 kDa, which can be dissociated into a monomer by denaturation with 2.5 m guanidine hydrochloride or during SDS-polyacrylamide electrophoresis. Opticin remains a dimer after removal of the amino-terminal region by O-sialoglycoprotein endopeptidase digestion, suggesting that dimer formation is mediated by the leucine-rich repeats. Dimerization could have a number of functional consequences, including divalent ligand interactions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,217

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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