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Enregistrement W2122408975 · doi:10.1055/s-0037-1616524

Evidence of a Founder Effect for the Protein C Gene 3363 Inserted C Mutation in Thrombophilic Pedigrees of French Origin

2001· article· en· W2122408975 sur OpenAlexaffabout
Edwin Bovill, Christine Demers, Robert Delage, Bruce Scott, Julia Valliere, Peter Callas, Michèle Jomphe, Frits R. Rosendaal, Martine Aiach, George Long, Patrick Couture

Notice bibliographique

RevueThrombosis and Haemostasis · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood Coagulation and Thrombosis Mechanisms
Établissements canadiensCentre hospitalier de l'Université LavalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésGeneticsFounder effectLocus (genetics)HaplotypeBiologyProbandAllelePedigree chartMutationHeterozygote advantageExonGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have previously reported that the 3363 inserted (Ins) C mutation in exon 6 of the protein C gene was present in four unrelated French patients and in four French Canadian families with type I protein C deficiency as well as in a large Vermont protein C deficient kindred of French Canadian origin. The present study was designed to investigate the likelihood of the existence of a founder effect for this mutation in protein C deficient individuals of French origin living in France, Quebec and Vermont. In order to demonstrate a possible founder effect for the 3363 InsC mutation, we have previously constructed a high-resolution genetic map to locate several highly polymorphic markers close to the protein C locus. Thereafter, the markers D2S347, D2S2339, D2S383, D2S2271 and D2S2215 were genotyped in 117 heterozygotes from France (n = 7), Quebec (n = 36) or Vermont (n = 74). The allelic frequency distribution of these five markers was also determined in fifty control French Canadian subjects and thirty-two unaffected members of the Vermont kindred with normal protein C levels and compared with their frequency in our cohort of heterozygotes. Our data suggest that patients from Quebec and Vermont carry a common haplotype at the protein C locus. Moreover, in order to study the evolutionary history of the 3363 InsC mutation, we traced back the ascending genealogy of one proband in each of the families with this mutation. These results showed that the 3363 InsC mutation was most probably introduced in North America by a couple of French settlers who established themselves in 1669 on Isle d'Orleans located near Quebec City. All heterozygotes for the 3363 InsC mutation living in North America are related to these founders within 10 generations. Thus, these families afford a unique opportunity to evaluate the role of the protein C system in thrombophilia due to the high degree of linkage disequilibrium at the protein C gene, which in essence holds that variable more constant than in a more heterogeneous population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,088
Score d'incertitude au seuil0,175

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,137
Tête enseignante GPT0,367
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2001
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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