Parentage and grandparentage assignment with known and unknown matings: application to Connecticut River Atlantic salmon restoration
Notice bibliographique
Résumé
Large-scale use of parentage assignment of stocked Connecticut River, U.S.A., Atlantic salmon (Salmo salar) fry to determine stocking tributary of emigrating smolts and returning adults requires both parentage assignment and grandparentage assignment. Using computer simulations, we explored the levels of genetic diversity necessary to provide adequate parentage and grandparentage assignment. When matings were known, as in a hatchery, 95% correct grandparentage assignment typically required at least twofold more alleles per locus than did 95% correct parentage assignment. Parentage assignment with unknown matings (as in the wild when parental genotypes can be assayed) required an intermediate number of alleles per locus and grandparentage assignment with unknown matings required the greatest genetic diversity. Computer simulations using empirical parental genotypes (14 loci) and known P1 matings indicated that the genetic diversity of Connecticut River Atlantic salmon broodstock is sufficient to assign all F1 and 97% of F2 offspring to the correct set of two parents or four grandparents, respectively. Grandparentage assignment with unknown P1 matings was ineffective (assignment success = 20%). These results indicate that the combination of parentage and grandparentage assignment can be used as a non-lethal, permanent, heritable "mark" to identify stocking tributary or other management directed characteristics of stocked fry.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».