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Enregistrement W2122506929 · doi:10.1002/cncr.25938

Hypoxic regulation and prognostic value of LAMP3 expression in breast cancer

2011· article· en· W2122506929 sur OpenAlexaff
Anika Nagelkerke, Hilda Mujčić, Johan Bussink, Bradly G. Wouters, Hanneke W.M. van Laarhoven, Fred C.G.J. Sweep, Paul N. Span

Notice bibliographique

RevueCancer · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBreast cancerMedicineOncologyInternal medicineProportional hazards modelImmunohistochemistryRadiation therapyHazard ratioMetastasisCA15-3CancerPathologyConfidence interval

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: LAMP3 is a newly described hypoxia regulated gene of potential interest in hypoxia-induced therapy resistance and metastasis. The prognostic value of LAMP3 in breast cancer was investigated. METHODS: Expression levels of LAMP3 in breast cancer cell lines and patient tissues were determined by real-time polymerase chain reaction and in a tissue microarray by immunohistochemistry. Immunofluorescent staining was used to evaluate the distribution of LAMP3 in tumor xenografts relative to pimonidazole. Kaplan-Meier analysis as well as multivariate Cox regression survival analyses were performed. RESULTS: LAMP3 was variably expressed in breast cancer cell lines and induced in an oxygen concentration-dependent manner. LAMP3 protein expression colocalized with hypoxic areas in breast cancer xenografts. LAMP3 mRNA was higher in breast tumors from patients with node-positive (P = .019) and/or steroid hormone receptor-negative tumors (P < .001). Breast cancer patients with high LAMP3 mRNA levels had more locoregional recurrences (P = .032 log-rank). This was limited to patients treated with lumpectomy and radiotherapy as primary treatment (n = 53, P = .009). No association with metastasis-free survival was found. In multivariate Cox regression analysis, LAMP3 remained as a statistically independent prognostic factor for locoregional recurrence (hazard ratio, 2.76; 95% confidence interval, 1.01-7.5; P = .048) after correction for menopausal status, histologic grade, tumor size, nodal status, therapy, and steroid hormone receptor status. LAMP3 protein in breast cancer tissue proved also to be of prognostic relevance. CONCLUSIONS: Evidence was provided for an association of LAMP3 with tumor cell hypoxia in breast cancer xenografts. In the current breast cancer cohorts, LAMP3 had independent prognostic value.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,594
Score d'incertitude au seuil0,349

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations81
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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