The Case for a Genetic Predisposition to Serrated Neoplasia in the Colorectum: Hypothesis and Review of the Literature
Notice bibliographique
Résumé
In recent years, an alternative pathway of colorectal cancer development has been described in which serrated polyps replace the traditional adenoma as the precursor lesion. Importantly, serrated polyps and a subset of colorectal cancer show largely nonoverlapping mutation profiles to those found in adenomas and the majority of colorectal cancer. These genetic alterations include activating mutation of the BRAF proto-oncogene and widespread gene promoter hypermethylation (CpG island methylator phenotype or CIMP). Up to 15% of colorectal cancer is likely to develop on the basis of a strong genetic predisposition. The two most well-characterized syndromes, familial adenomatous polyposis and hereditary nonpolyposis colorectal cancer (Lynch syndrome), both develop via the adenoma-carcinoma pathway and together account for approximately one third of familial colorectal cancer. We have recently described 11 families in which there is evidence that the genetic predisposition to autosomal dominant colorectal cancer is linked to the serrated pathway. This condition, serrated pathway syndrome, and the related condition, hyperplastic polyposis, the presentation of which suggests a recessive mode of inheritance, represent two syndromes in which BRAF mutation and methylation co-occur within serrated precursor lesions. Further, CIMP is observed in the normal colonic mucosa of individuals with hyperplastic polyposis consistent with a field defect in epigenetic regulation. The spectrum of serrated neoplasia may also implicate the apparently sporadic and later onset subset of colorectal cancer with high levels of microsatellite instability. The tendency for these lesions to be multiple, associated with smoking, and to show frequent BRAF mutation and CIMP points to a defect that may result from interactions between the environment and a weakly penetrant genetic alteration.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,007 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,003 |
| Communication savante | 0,002 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,006 | 0,004 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».