The Saccharomyces cerevisiae Peroxisomal Import Receptor Pex5p Is Monoubiquitinated in Wild Type Cells
Notice bibliographique
Résumé
Pex5p is a mobile receptor for peroxisomal targeting signal type I-containing proteins that cycles between the cytoplasm and the peroxisome. Here we show that Pex5p is a stable protein that is monoubiquitinated in wild type cells. By making use of mutants defective in vacuolar or proteasomal degradation we demonstrate that monoubiquitinated Pex5p is not a breakdown intermediate of either system. Monoubiquitinated Pex5p is localized to peroxisomes, and ubiquitination requires the presence of functional docking and RING finger complexes, which suggests that it is a late event in peroxisomal matrix protein import. In pex1, pex4, pex6, pex15, and pex22 mutants, all of which are blocked in the terminal steps of peroxisomal matrix protein import, polyubiquitinated forms of Pex5p accumulate, ubiquitination being dependent on the ubiquitin-conjugating enzyme Ubc4p. However, Ubc4p is not required for Pex5p ubiquitination in wild type cells, and cells lacking Ubc4p are not affected in peroxisome biogenesis. These results indicate that Pex5p monoubiquitination in wild type cells serves to regulate rather than to degrade Pex5p, which is supported by the observed stability of Pex5p. We propose that Pex5p monoubiquitination in wild type cells is required for the recycling of Pex5p from the peroxisome, whereas Ubc4p-mediated polyubiquitination of Pex5p in mutants blocked in the terminal steps of peroxisomal matrix protein import may function as a disposal mechanism for Pex5p when it gets stuck in the import pathway.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».