GCN4 enhances the stability of the pore domain of potassium channel KcsA
Notice bibliographique
Résumé
The prokaryotic potassium channel from Streptomyces lividans, KcsA, is the first channel that has a known crystal structure of the transmembrane domain. The crystal structure of its soluble C-terminal domain, however, still remains elusive. Biophysical and electrophysiological studies have previously implicated the essential roles of the C-terminal domain in pH sensing and in vivo channel assembly. We examined this functional assignment by replacing the C-terminal domain with an artificial tetramerization domain, GCN4-LI. The expression of KcsA is completely abolished when its C-terminal domain is deleted, but it can be rescued by fusion with GCN4-LI. The secondary and quaternary structures of the hybrid channel are very similar to those of the wild-type channel according to CD and gel-filtration analyses. The thermostability of the hybrid channel at pH 8 is similar to that of the wild-type but is insensitive to pH changes. This supports the notion that the pH sensor of KcsA is located in the C-terminal domain. The result obtained in the present study is in agreement with the proposed functions of the C-terminal domain and we show that the channel assembly role of the C-terminal domain can be substituted with a non-native tetrameric motif. Because tetramerization domains are found in different families of potassium channels and their presence often enhances the expression of channels, replacement of the elusive C-terminal domains with a known tetrameric scaffold could potentially assist the expression of other potassium channels.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».