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Enregistrement W2122713520 · doi:10.1530/rep-06-0292

A molecular analysis of the population of mRNA in bovine spermatozoa

2007· article· en· W2122713520 sur OpenAlexafffund
Isabelle Gilbert, Nathalie Bissonnette, Guylain Boissonneault, Maud Vallée, Claude Robert

Notice bibliographique

RevueReproduction · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSperm and Testicular Function
Établissements canadiensUniversité de SherbrookeAgriculture and Agri-Food CanadaUniversité Laval
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésSpermiogenesisBiologyMessenger RNARNATranscriptomePopulationSpermCell biologyGeneticsGene expressionGeneMolecular biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Spermiogenesis represents the transition from haploid spermatids to spermatozoa. This process entails an extreme condensation of the nucleus and a loss of nearly all cytoplasmic content. The presence of messenger RNAs in the spermatozoa has previously been shown. Generally, these transcripts are considered to be remnants of spermiogenesis. However, it has recently been proposed that there may exist a function for these sperm-associated RNAs. To address the possibility of a functional role for these transcripts, we sought to investigate and characterize the RNA pool found in bovine spermatozoa. The main goals of this study were to examine RNA integrity and survey the mRNA found in spermatids and spermatozoa. Assessment of mRNAs integrity was performed by three approaches: microelectrophoresis, comparative smearing after global amplification, and PCR amplification of target sequences located either in the 5' or the 3' ends, while mRNAs survey was performed by microarray hybridizations. RNA integrity studies in the spermatozoa showed a majority of low molecular size fragments indicating a natural segmentation of the mRNA population. The mRNA survey indicated that the sperm transcriptome harbors a complex mixture of messengers implicated in a wide array of cell functions and representing a large subset of transcripts found in spermatids. Subsequently, such sperm RNA profiling could allow the molecular diagnosis of male gamete quality.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations126
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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