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Enregistrement W2122825774 · doi:10.2337/db06-1555

Toward Further Mapping of the Association Between the <i>IL2RA</i> Locus and Type 1 Diabetes

2007· article· en· W2122825774 sur OpenAlexafffund
Hui‐Qi Qu, Alexander Montpetit, Bing Ge, Thomas J. Hudson, Constantin Polychronakos

Notice bibliographique

RevueDiabetes · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDiabetes and associated disorders
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University and Génome Québec Innovation CentreMontreal Children's Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchOntario GenomicsOntario Genomics InstituteGenome Canada
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismLinkage disequilibriumHaplotypeType 2 diabetesGeneticsTCF7L2Locus (genetics)BiologyGenetic associationCandidate geneType 1 diabetesGenotypeGeneDiabetes mellitusEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A novel type 1 diabetes locus was mapped to the interleukin-2 receptor alpha gene (IL2RA) on chromosome 10p15.1, encoding an important modulator of immunity. The aim of the current study was to confirm the association of IL2RA with type 1 diabetes and to attempt further mapping of the genetic effect with a new set of 12 single nucleotide polymorphisms (SNPs). We genotyped 949 nuclear family trios with one type 1 diabetes-affected offspring and two parents (2,847 individuals). Two of the 12 IL2RA SNPs genotyped (rs706778 and rs3118470) had statistically significant type 1 diabetes association (P = 6.96 x 10(-4) and 8.63 x 10(-4), respectively). Both SNPs are located in the 5' end of the long intron 1 within 3 kb of each other and are in high linkage disequilibrium (D' = 0.997, r(2) = 0.613). The A-C haplotype (frequency = 0.331) was associated with increased type 1 diabetes risk (P = 3.02 x 10(-4)). Our study identifies two markers in the IL2RA gene that are significantly associated with type 1 diabetes, supporting IL2RA as a promising candidate gene for type 1 diabetes and suggesting a potential role of IL2Ralpha in the pathogenesis of type 1 diabetes, likely involving regulatory T-cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,307
Score d'incertitude au seuil0,297

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations95
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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