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Enregistrement W2122941215 · doi:10.1085/jgp.200609652

Functional Characterization and Molecular Cloning of the K+-dependent Na+/Ca2+ Exchanger in Intact Retinal Cone Photoreceptors

2006· article· en· W2122941215 sur OpenAlexaff
Christophe Paillart, Robert J. Winkfein, Paul P. M. Schnetkamp, Juan I. Korenbrot

Notice bibliographique

RevueThe Journal of General Physiology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRetinalCloning (programming)BiophysicsChemistryRetinaCell biologySodium–hydrogen antiporterBiologyAnatomyNeuroscienceBiochemistrySodiumComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Light-dependent changes in cytoplasmic free Ca(2+) are much faster in the outer segment of cone than rod photoreceptors in the vertebrate retina. In the limit, this rate is determined by the activity of an electrogenic Na(+)/Ca(2+) exchanger located in the outer segment plasma membrane. We investigate the functional properties of the exchanger activity in intact, single cone photoreceptors isolated from striped bass retina. Exchanger function is characterized through analysis both of the electrogenic exchanger current and cytoplasmic free Ca(2+) measured with optical probes. The exchanger in cones is K(+) dependent and operates both in forward and reverse modes. In the reverse mode, the K(+) dependence of the exchanger is described by binding to a single site with K(1/2) about 3.6 mM. From the retina of the fish we cloned exchanger molecules bassNCKX1 and bassNCKX2. BassNCKX1 is a single class of molecules, homologous to exchangers previously cloned from mammalian rods. BassNCKX2 exists in four splice variants that differ from each other by small sequence differences in the single, large cytoplasmic loop characteristic of these molecules. We used RT-PCR (reverse transcriptase polymerase chain reaction) of individual cells to identify the exchanger molecule specifically expressed in bass single and twin cone photoreceptors. Each and every one of the four bassNCKX2 splice variants is expressed in both single and twin cones indistinguishably. BassNCKX1 is not expressed in cones and, by exclusion, it is likely to be an exchanger expressed in rods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,401
Score d'incertitude au seuil0,218

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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