Phylogeographic pattern of Populus cathayana in the southeast of Qinghai-Tibetan Plateau of China revealed by cpSSR markers
Notice bibliographique
Résumé
The vegetation in the Qinghai-Tibetan Plateau is thought to be highly sensitive and more vulnerable to global climate change than that of other areas. The uplift of the plateau as well as the climatic oscillations during glacial periods had a profound impact on plant species distribution and genetic diversity there. In the present study, seven pairs of cpSSR (chloroplast Simple Sequence Repeat) primers were utilized to detect genetic varieties of Populus cathayana Rehd populations from their natural range in the southeastern areas of Qinghai-Tibetan Plateau. A total of 28 alleles and 12 different haplotypes were detected. The proportion of haplotype variation among populations (G = 0.794, N = 0.900) indicated high level of genetic differentiation among populations and a significant phylogeographic structure (N > G, P < 0.05). This appears to support the hypothesis that these populations were derived from multiple refugia areas during the Quaternary climatic oscillations. Based on the haplotype network and mismatch distribution analyses, we found no evidence of postglacial range recolonization and expansion by P. cathayana in this region. This might be mainly due to the complex topography of the southeastern part of the Qinghai-Tibetan Plateau. The lofty mountain ranges and deep valleys in this region might have prevented long-distance migrations of this species during the climatic amelioration.STSTSTST
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».