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Enregistrement W2123015250 · doi:10.1093/glycob/cwg106

Occurrence of a nontypable Helicobacter pylori strain lacking Lewis blood group O antigens and DD-heptoglycan: evidence for the role of the core  1,6-glucan chain in colonization

2003· article· en· W2123015250 sur OpenAlexaff
Eleonora Altman, Н. И. Смирнова, Jianjun Li, Annie Aubry, Susan M. Logan

Notice bibliographique

RevueGlycobiology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHelicobacter pylori-related gastroenterology studies
Établissements canadiensNational Research Council CanadaInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHelicobacter pyloriLipopolysaccharideAntigenMicrobiologyGlycoconjugateCell envelopeStrain (injury)BiologyBacterial outer membraneChemistryImmunologyBiochemistryEscherichia coliGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cell envelope of Helicobacter pylori contains a lipopolysaccharide (LPS) essential for the physical integrity and functioning of the bacterial cell membrane. The O-chain of this LPS frequently expresses type 2 Lewis x (Lex) and Lewis y (Ley) blood group antigens that mimic human gastric mucosal cell-surface glycoconjugates. This article describes the isolation and structural analysis of the LPS from a clinical isolate of H. pylori strain PJ2 that lacks Le antigens but is still capable of colonization. Subsequent composition, methylation, and CE-ESMS analyses of LPS revealed its core oligosaccharide structure to be consistent with the previously proposed structural model for H. pylori LPS. In addition, it carries an unusually long side branch alpha1,6-glucan and was devoid of Le O-chain polysaccharide. Its ability to colonize the mouse stomach was essentially identical to that of DD-heptoglycan- and Le antigen- producing H. pylori strains.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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