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Enregistrement W2123054375 · doi:10.1177/0300985812467469

In Vitro Characterization of Influenza A Virus Attachment in the Upper and Lower Respiratory Tracts of Pigs

2012· article· en· W2123054375 sur OpenAlexaff
Susan E. Detmer, Marie Gramer, Sagar M. Goyal, M. Torremorell

Notice bibliographique

RevueVeterinary Pathology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesU.S. Department of Agriculture
Mots-clésBiologyVirusVirologyRespiratory tractIn vitroVirulenceHemagglutinin (influenza)Influenza A virusRespiratory systemFluorescein isothiocyanateGeneGeneticsAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The binding of influenza A viruses to epithelial cells in the respiratory tract of mammals is a key step in the infection process. Therefore, direct assessment of virus-host cell interaction using virus histochemistry (VH) will enhance our understanding of the pathogenesis of these new viruses. For this study, the authors selected viruses that represented the 4 main genetic clusters of North American swine H1 (SwH1) viruses, along with A/California/04/2009 H1N1 and a vaccine strain for the positive controls, and the virus label, fluorescein isothiocyanate (FITC), for the negative control. A group of 5 viruses containing a 2-amino acid insertion adjacent to the binding site of the hemagglutinin protein and their presumed ancestral viruses were also examined for changes in binding patterns. Viruses were bound to formalin-fixed paraffin-embedded, 6-week-old (6w) and adult pig tissues. Qualitative VH scores per respiratory zone ranged from + to +++, with bronchioles having the highest and most consistent scores, regardless of animal age. For the 6w bronchioles, a quantitative VH score was calculated using digital images of 5 bronchioles per tissue section using image analysis software. Significant differences in attachment were found among the SwH1 viruses (P < .0001) and among the ancestral and insertion viruses (P < .0001). These results provide new insights on virus binding to porcine respiratory epithelial cells and the usefulness of morphometric scores. The results also highlight limitations of in vitro techniques, including VH for predicting virulence and host range.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,860
Score d'incertitude au seuil0,320

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,118
Tête enseignante GPT0,401
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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