MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2123156231 · doi:10.1186/2041-9139-3-20

Understanding the basis of a novel fruit type in Brassicaceae: conservation and deviation in expression patterns of six genes

2012· article· en· W2123156231 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueEvoDevo · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaHarvard University
Mots-clésBrassicaceaeBiologyExpression (computer science)Developmental biologyType (biology)Evolutionary biologyGeneBotanyGeneticsEcologyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Variation in fruit morphology is important for plant fitness because it influences dispersal capabilities. Approximately half the members of tribe Brassiceae (Brassicaceae) exhibit fruits with segmentation and variable dehiscence, called heteroarthrocarpy. The knowledge of the genetics of fruit patterning in Arabidopsis offers the opportunity to ask: (1) whether this genetic pathway is conserved in taxa with different fruit morphologies; (2) how the pathway may be modified to produce indehiscence; and (3) whether the pathway has been recruited for a novel abscission zone. METHODS: We identified homologs of ALCATRAZ, FRUITFULL, INDEHISCENT, SHATTERPROOF, and REPLUMLESS from two taxa, representing different types of heteroarthrocarpy. Comparative gene expression of twelve loci was assessed to address how their expression may have been modified to produce heteroarthrocarpy. RESULTS: Studies demonstrated overall conservation in gene expression patterns between dehiscent segments of Erucaria erucarioides and Arabidopsis, with some difference in expression of genes that position the valve margin. In contrast, indehiscence in heteroarthrocarpic fruit segments was correlated with the elimination of the entire valve margin pathway in Erucaria and Cakile lanceolata as well as its absence from a novel lateral abscission zone. CONCLUSIONS: These findings suggest that modifications in the valve margin positioning genes are responsible for differences between heteroarthrocarpic and Arabidopsis-like fruits and support the hypothesis that heteroarthrocarpy evolved via repositioning the valve margin. They also highlight conservation in the dehiscence pathway across Brassicaceae.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,435
Score d'incertitude au seuil0,100

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,141
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,147 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle