Understanding the basis of a novel fruit type in Brassicaceae: conservation and deviation in expression patterns of six genes
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Variation in fruit morphology is important for plant fitness because it influences dispersal capabilities. Approximately half the members of tribe Brassiceae (Brassicaceae) exhibit fruits with segmentation and variable dehiscence, called heteroarthrocarpy. The knowledge of the genetics of fruit patterning in Arabidopsis offers the opportunity to ask: (1) whether this genetic pathway is conserved in taxa with different fruit morphologies; (2) how the pathway may be modified to produce indehiscence; and (3) whether the pathway has been recruited for a novel abscission zone. METHODS: We identified homologs of ALCATRAZ, FRUITFULL, INDEHISCENT, SHATTERPROOF, and REPLUMLESS from two taxa, representing different types of heteroarthrocarpy. Comparative gene expression of twelve loci was assessed to address how their expression may have been modified to produce heteroarthrocarpy. RESULTS: Studies demonstrated overall conservation in gene expression patterns between dehiscent segments of Erucaria erucarioides and Arabidopsis, with some difference in expression of genes that position the valve margin. In contrast, indehiscence in heteroarthrocarpic fruit segments was correlated with the elimination of the entire valve margin pathway in Erucaria and Cakile lanceolata as well as its absence from a novel lateral abscission zone. CONCLUSIONS: These findings suggest that modifications in the valve margin positioning genes are responsible for differences between heteroarthrocarpic and Arabidopsis-like fruits and support the hypothesis that heteroarthrocarpy evolved via repositioning the valve margin. They also highlight conservation in the dehiscence pathway across Brassicaceae.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».