MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2123186607 · doi:10.3201/eid1601.090729

Ceftiofur Resistance in<i>Salmonella enterica</i>Serovar Heidelberg from Chicken Meat and Humans, Canada

2009· article· en· W2123186607 sur OpenAlexafffundabout
Lucie Dutil, Rebecca Irwin, Rita Finley, Lai King Ng, Brent P. Avery, Patrick Boerlin, Anne-Marie Bourgault, L. Cole, Danielle Daignault, Andrea Desruisseau, Walter Demczuk, Linda Hoang, Greg B. Horsman, Johanne Ismaïl, Frances Jamieson, Anne Maki, Ana Pacagnella, Dylan R. Pillai

Notice bibliographique

RevueEmerging infectious diseases · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensInstitut National de Santé Publique du QuébecBC Centre for Disease ControlSaskatchewan Disease Control LaboratoryPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesHealth CanadaPublic Health AgencyPublic Health Agency of CanadaAgriculture and Agri-Food CanadaCanadian Food Inspection Agency
Mots-clésSalmonella entericaSerotypeCeftiofurSalmonellaMicrobiologyBiologyVirologyVeterinary medicineAntibiotic resistanceMedicineGeneticsBacteriaAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Canadian Integrated Program for Antimicrobial Resistance Surveillance describes a strong correlation (r = 0.9, p<0.0001) between ceftiofur-resistant Salmonella enterica serovar Heidelberg isolated from retail chicken and incidence of ceftiofur-resistant Salmonella serovar Heidelberg infections in humans across Canada.In Québec, changes of ceftiofur resistance in chicken Salmonella Heidelberg and Escherichia coli isolates appear related to changing levels of ceftiofur use in hatcheries during the study period, from highest to lowest levels before and after a voluntary withdrawal, to increasing levels after reintroduction of use (62% to 7% to 20%, and 34% to 6% to 19%, respectively).These events provide evidence that ceftiofur use in chickens results in extended-spectrum cephalosporin resistance in bacteria from chicken and humans.To ensure the continued effectiveness of extended-spectrum cephalosporins for treating serious infections in humans, multidisciplinary efforts are needed to scrutinize and, where appropriate, limit use of ceftiofur in chicken production in Canada. S almonella enterica serovar Heidelberg ranks amongthe top 3 serovars isolated from persons infected with Salmonella in Canada (1).It is more frequently reported in North America than in other regions of the world (2).Although many Salmonella Heidelberg infections result in mild to moderate illness, the bacterium also causes severe illness with complications such as septicemia, myocarditis, extraintestinal infections, and death (3,4).Salmonella Heidelberg appears more invasive than other gastroenteritis-causing serovars; ≈9% of isolates of this serovar received through the Canadian Integrated Program for Antimicrobial Resistance Surveillance (CIPARS) during 2003-2005 were recovered from blood samples (5).Treatment with antimicrobial agents may be life-saving in the case of invasive infections.Sources of human Salmonella Heidelberg infection include consumption of poultry or eggs and egg-containing products (6-10).In Canada, Salmonella Heidelberg is commonly isolated from healthy chickens from farm, abattoir, and retail sources (11,12).It also has been isolated, although less frequently, from ground beef, pork, and turkey meat (13-15) and from clinical samples from various animal species (12).Ceftiofur is an extended-spectrum cephalosporin drug approved in Canada for use with numerous label indications in cattle, swine, horses, sheep, turkeys, dogs, and cats.Ceftiofur is also injected in ovo to control Escherichia coli omphalitis in broiler chickens; this use is not an approved label indication.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,053

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations429
Publié2009
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueEmerging infectious diseasesMême sujetSalmonella and Campylobacter epidemiologyTravaux en français237 207