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Enregistrement W2123273660 · doi:10.1242/jeb.034116

Carbonic anhydrase expression and CO2 excretion during early development in zebrafish<i>Danio rerio</i>

2009· article· en· W2123273660 sur OpenAlexaff
Kathleen M. Gilmour, Kimberley Thomas, Andrew J. Esbaugh, Steve F. Perry

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensOntario GenomicsUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésExcretionCarbonic anhydraseGene knockdownBiologyDanioMorpholinoAcetazolamideZebrafishInternal medicineEndocrinologyBiochemistryEnzymeGenePhysiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Carbonic anhydrase (CA) is critical for CO2 excretion in adult fish, but little is known of the expression or function of CA during early development. The present study examined the hypothesis that, as rates of CO2 production increased during early development in zebrafish (Danio rerio), CA would become necessary for effective CO2 excretion, and that the pattern of CA expression during early development would reflect this transition. Real-time RT-PCR was used to examine the mRNA expression of the two main intracellular CA isoforms over a time course of early development ranging from 0 to 120 h post fertilization (h.p.f.). The mRNA expression of zCAb was generally higher than that of zCAc, particularly during the earliest stages of development. Rates of CO2 excretion increased approximately 15-fold from 24 to 48 h.p.f. whereas rates of O2 uptake increased only 6.7-fold over the same period, indicating a relative stimulation of CO2 excretion over O2 uptake. Treatment of 48 h.p.f. larvae with the CA inhibitor acetazolamide resulted in CO2 excretion rates that were 52% of the value in control larvae, a significant difference that occurred in the absence of any effect on O2 uptake. Antisense morpholino oligonucleotides were used to selectively knock down one or both of the main intracellular CA isoforms. Subsequent measurement of gas transfer rates at 48 h.p.f. indicated that CA knockdown caused a significant relative inhibition of CO2 excretion over O2 uptake, regardless of which cytosolic CA isoform was targeted for knockdown. These results suggest that between 24 h.p.f. and 48 h.p.f., developing zebrafish begin to rely on CA to meet requirements for increased CO2 excretion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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