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Enregistrement W2123296725 · doi:10.1200/jco.2003.11.007

Single Nucleotide Polymorphism of the Human Kallikrein-2 Gene Highly Correlates With Serum Human Kallikrein-2 Levels and in Combination Enhances Prostate Cancer Detection

2003· article· en· W2123296725 sur OpenAlexaff
Robert K. Nam, William Zhang, John Trachtenberg, Eleftherios P. Diamandis, Ants Toi, Marjan Emami, Minnie Ho, Joan Sweet, Andrew Evans, Michael A.S. Jewett, Steven A. Narod

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCoagulation, Bradykinin, Polyphosphates, and Angioedema
Établissements canadiensMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProstate cancerMedicineGenotypeOdds ratioInternal medicineSingle-nucleotide polymorphismKallikreinCancerConfidence intervalAlleleProstate-specific antigenProstate biopsyOncologyGastroenterologyGeneBiologyGeneticsEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: We examined the relationship between a mutant (T) for wild-type (C) allele substitution of the human kallikrein-2 gene (KLK2), circulating human kallikrein-2 (hK2) levels and prostate cancer risk. PATIENTS AND METHODS: We studied 1,287 consecutive men who underwent prostate biopsies because of an abnormal prostate-specific antigen level. Serum and DNA were obtained before biopsy. Cases were patients with cancer, and controls were patients with no cancer. The mutant and wild-type alleles of the KLK2 gene were designated as the T and C alleles, respectively. RESULTS: Of the 1,287 men, 616 had cancer, and 671 had no cancer. The overall distribution of the CC, CT, and TT KLK2 genotypes was 55.1%, 38.2%, and 6.8%, respectively. The median hK2 levels for men with the CC, CT, and TT genotypes were 0.24, 0.18, and 0.062 ng/mL and correlated with the genotypes, respectively (P =.0001). The adjusted odds ratios for prostate cancer for patients with the TT and CT genotypes compared with patients with the CC genotype, were 2.13 (95% confidence interval [CI], 1.3 to 3.5; P =.004) and 1.51 (95% CI, 1.2 to 2.0; P =.002), respectively. The adjusted odds ratio for prostate cancer for patients in the fourth quartile of hK2 compared with the first quartile was 4.33 (95% CI, 2.9 to 6.4; P =.0001). When combined, the adjusted odds ratio for having prostate cancer was 13.92 (95% CI, 6.6 to 29.2; P =.0001) for patients with high hK2 levels and at least one T allele. CONCLUSION: The C/T polymorphism of the KLK2 gene and circulating levels of hK2 are correlated and, in combination, are highly predictive for prostate cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,375
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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